Moteur de recherche Veille sanitaire internationale

Enquête sur Popillia japonica dans le cadre du projet Horizon 2020 IPM Popillia, ciblant la viticulture (lien direct au questionnaire ici : https://ww2.unipark.de/uc/popillia_summer23/).

PhytoPipe est un pipeline bioinformatique open source développé pour détecter les agents phytopathogènes. Cet outil convivial intègre l’analyse et la visualisation des données de séquençage ARN à haut débit (HTS), il permet le diagnostic rapide de virus et viroïdes, mais aussi de bactéries (incluant les phytoplasmes), de champignons et d’oomycètes. PhytoPipe combine différents outils et bases de données, il est implémenté dans le workflow Snakemake avec Python 3 et des scripts bash dans un environnement Linux. Le code source de PhytoPipe est disponible gratuitement et distribué sous licence BSD-3.

D’ici 20 ans, l’ensemble de l’État de Washington pourrait être infesté par l’espèce exotique envahissante Popillia japonica. Cette projection est issue d’une étude scientifique basée sur un modèle d’adéquation de l’habitat du ravageur à Washington et utilisant des modèles de dispersion (accès direct ici [ https://academic.oup.com/jee/advance-article-abstract/doi/10.1093/jee/toad116/7198620?redirectedFrom=fulltext&login=false]).

Des foyers de Flavescence dorée ont été découverts à différents endroits, situés à l’intérieur ou à l’extérieur des zones délimitées existantes. Voir la mise à jour des zones délimitées ici (https://www.gov.si/assets/organi-v-sestavi/UVHVVR/Zdravje-rastlin/Skodljivi-organizmi-rastlin/Zlata-trsna-rumenica/Nacrt-izrednih-ukrepov-za-zlato-trsno-rumenico-Grapevine-flavescence-doree-v-Republiki-Sloveniji.docx).

La mouche orientale des fruits, Bactrocera dorsalis, a été détecté en Belgique. Trois individus ont été capturés depuis fin août dans des endroits distincts : un à Anvers (Flandre), un à Anderlecht (Bruxelles) et un à Courcelles, près de Charleroi (Wallonie).

À partir du 1er janvier 2024, de nouvelles exigences et inspections associées s’appliqueront à l’importation de plantes hôtes d’Anoplophora chinensis en provenance de tous les pays tiers

Cette revue évalue l’évolution possible de la pression des maladies sur les plantes selon des scenarii climatiques futurs et fait le lien avec la productivité des plantes dans les systèmes agricoles et naturels. Les impacts actuels et futurs du changement climatique sont explorés sur la biogéographie des agents pathogènes, sur l’incidence et la sévérité des maladies, et leurs effets sur les écosystèmes naturels, l'agriculture et la production alimentaire.

Un nouveau protocole de PCR quantitative en temps réel basé sur la sonde TaqMan, qui peut également être réalisée dans une version de PCR conventionnelle, a été développé pour détecter les quatre espèces phytopathogènes connues du genre Liberibacter (‘Ca. Liberibacter asiaticus’, ‘Ca. Liberibacter americanus’, ‘Ca. Liberibacter africanus’, et ‘Ca. Liberibacter solanacearum’). Le nouveau protocole a été validé selon les directives de l’Organisation Européenne et méditerranéenne pour la Protection des Plantes (OEPP). Cette méthode permet la détection de CaLas, CaLam, CaLaf et CaLsol dans les plantes et les vecteurs, non seulement en utilisant de l’ADN purifié, mais également en utilisant des extraits bruts de pomme de terre, d’agrumes ou de psylles.

La présence d’œufs, nymphes et adultes de Diaphorina citri et Trioza erytreae (vecteurs du HLB) est signalée pour la première fois au Ghana. Les analyses de ces vecteurs ont montré l’absence des 3 espèces de Candidadus Liberibacter spp. causant le HLB.

Sur mandat de la Commission européenne, l’EFSA a créé et met régulièrement à jour une base de données des espèces végétales hôtes de Xylella spp. Le mandat actuel couvre la période 2021-2026. Le nombre total des plantes hôtes de Xylella fastidiosa déterminées avec au moins deux méthodes de détection différentes ou positives avec une méthode (entre séquençage et isolement en culture pure) atteint désormais 423 espèces végétales, 194 genres et 68 familles. Ces chiffres s’élèvent à 679 espèces végétales, 304 genres et 88 familles si on les considère quelles que soient les méthodes de détection appliquées. Cette mise à jour fait aussi apparaitre deux nouveaux types génétiques (ST88 et ST89) appartenant à la sous-espèce multiplex.

Une étude basée sur des analyses génomiques (marqueurs SNP et ADN mitochondriaux) des populations de Spodoptera frugiperda asiatiques et pacifiques australes a permis d’identifier de multiples introductions liées aux activités humaines. Les résultats montrent l’existence de signatures génomiques différentes des populations de Myanmar et de la Chine. Ces signatures ne soutiennent ni l’hypothèse d’une “propagation d’origine africaine” ni celle d’une “population source du Myanmar vers la Chine”. Globalement, l’étude à identifié l’Asie comme un point chaud en terme de biosécurité et de diversité génétique de la légionnaire d’automne.