Virus des pommiers
Depuis plusieurs années, les techniques de séquençage à haut débit (HTS) ont permis d’identifier de nouveaux virus et viroïdes chez le pommier et autres arbres fruitiers. La répartition et l’impact potentiel sur les cultures restent encore mal connus. Améliorer les connaissances sur les symptômes, la présence et la distribution de ces organismes sur le territoire constitue ainsi un enjeu important pour évaluer les risques pour la filière pomme.
Les nouveaux agents pathogènes des pommiers
Les vergers de pommier peuvent héberger de nombreux virus et viroïdes. Certains sont historiquement connus et largement répandus, comme Apple stem grooving virus (ASGV), Apple stem pitting virus (ASPV), Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV) et Apple mosaic virus (ApMV).
Le développement du séquençage à haut débit (HTS) a permis d’identifier ou de mieux caractériser plusieurs organismes émergents en Europe, par exemple : Apple rubbery wood virus 1 (ARWV-1), Apple rubbery wood virus 2 (ARWV-2), Apple hammerhead viroid (AHVd), Apple luteovirus 1 (ALV-1) et Citrus concave gum-associated virus (CCGaV). Leur distribution, leurs voies de transmission et leur impact agronomique restent encore mal connus.
Travaux et avancées
Dans le cadre de la collaboration entre le CTIFL (www.ctifl.fr) et la Plateforme ESV, des travaux ont été initiés dans le cadre du projet VIRPOM porté par le CTIFL. L’analyse des données issues de premiers prélèvements réalisés sur le territoire pour les 9 organismes listés ci-dessus permet de réaliser un premier état des lieux de la présence des différents virus et viroïde étudiés et à mieux caractériser leur répartition au sein des bassins échantillonnés. Les premiers résultats ont mis en évidence la présence des 9 agents étudiés à des prévalences différentes à l’échelle nationale et à l’échelle des bassins de production. De nombreuses co-infections ont également été observées.
Sur la base de ces premiers résultats, un travail méthodologique est également mené afin de proposer un plan d’échantillonnage subsidiaire. Celui-ci a pour objectif d’améliorer les connaissances sur la distribution et la prévalence de ces agents à l’échelle du territoire français, en particulier dans les principaux bassins de production de pommes.
À terme, ces travaux doivent permettre de disposer d’une vision plus représentative de la situation sanitaire des vergers français.
Synthèse
En cours.
Références
Liens utiles