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Cette revue synthétise les connaissances actuelles sur le rôle du microbiome végétal dans la résistance des plantes aux maladies. Elle résume également les mécanismes sous-jacents à la modulation du microbiome guidée par la plante et la suppression des maladies par les probiotiques.

Cette revue analyse comment les événements climatiques extrêmes (vagues de chaleur, sécheresses prolongées, fluctuations rapides de température) influencent les agents pathogènes des plantes, la composition des microbiomes et plus largement, la santé végétale. Les auteurs soulignent que ces épisodes, plus intenses que les tendances climatiques de long terme, peuvent accroître la virulence et l’aire de répartition de nombreux agents pathogènes, affaiblir les défenses des plantes et perturber les fonctions clés des microbiomes.

Cette étude a examiné l'influence de la durée d'acquisition sur la dynamique précoce de colonisation du phytoplasme de la flavescence dorée chez son vecteur Euscelidius variegatus. Deux conditions d'acquisition sont comparées : 4h contre 2 jours. Les acquisitions très courtes (4h) produisent des charges phytoplasmiques significativement plus faibles après 8 jours de latence comparée aux acquisitions de 2 jours. Néanmoins, même après de brèves expositions, la charge augmente progressivement avec le temps, bien qu'elle reste inférieure aux acquisitions prolongées. Ces résultats révèlent comment la durée d'acquisition conditionne les premières phases de développement phytoplasmique chez les vecteurs et permettent d'évaluer le risque de transmission lors d'épisodes alimentaires accidentels en conditions naturelles.

Les maladies des plantes à l'interface entre milieux sauvages et cultures sont difficiles à gérer car les pathogènes peuvent circuler, persister et évoluer entre ces deux systèmes. À travers plusieurs exemples, l'article montre que les plantes sauvages peuvent agir comme réservoirs ou sources d'émergence de nouveaux pathogènes. Les auteurs proposent un cadre de modélisation pour aider à répartir les efforts de gestion entre milieux sauvages et cultivés et soulignent la nécessité d'une approche intégrée prenant en compte les facteurs écologiques et humains. Les études de cas concernent les organismes nuisibles suivants : Puccinia graminis, Phakopsora pachyrhizi, Xylella fastidiosa, Pyricularia oryzae (lignée Triticum) et Austropuccinia psidii sur Myrtacées et céréales.

Cette revue examine la capacité inhabituelle de certaines vignes atteintes de la maladie de Pierce (causée par Xylella fastidiosa) à récupérer après la dormance hivernale, devenant asymptomatiques sans détection bactérienne. Ce phénomène observé depuis plusieurs décennies varie selon les cépages, les conditions environnementales et les souches bactériennes. L’analyse des facteurs influençant ce phénomène, sur la base de données de la littérature, suggèrent l’implication de mécanismes propres à la plante, possiblement liés à une réinitialisation immunitaire durant la dormance, avec des implications importantes pour l’épidémiologie et la gestion future de la maladie.

L'esca, maladie fongique dévastatrice de la vigne, défie les modèles classiques : ses champignons associés (comme Phaeomoniella chlamydospora) se retrouvent aussi chez des vignes saines, et leur inoculation ne reproduit pas toujours les symptômes. Les chercheurs proposent une nouvelle approche : considérer l'esca comme un déséquilibre de l'écosystème microbien de la vigne plutôt qu'une simple infection. Les analyses révèlent que l'apparition des symptômes dépend moins de la présence des champignons que de leur activité dans le tronc et des réactions de la plante, amplifiées par des stress environnementaux comme la sécheresse. Cette découverte change l'approche de protection : plutôt que cibler des pathogènes spécifiques, il s'agit de renforcer la résistance naturelle en maintenant l'équilibre microbien. Ces travaux ouvrent la voie à des stratégies de détection précoce et de gestion viticole résiliente basées sur le microbiome.

Les nématodes à galles (Meloidogyne spp.) causent des dégâts significatifs en production maraîchère en Géorgie. Cette étude évalue le potentiel de reproduction de M. enterolobii (nématode du goyavier, classé organisme de quarantaine prioritaire en France), M. floridensis (nématode du pêcher) et M. incognita sur huit cultures maraîchères économiquement importantes : betterave, brocoli, chou, melon, poivron, haricot vert, courge et tomate. Les deux premières espèces ont été détectées pour la première fois en Géorgie lors d'une prospection récente.

Grâce au séquençage à haut débit à l’analyse phylo-génomique, un nouveau Badnavirus à ADN double brin a été identifié sur Prunus salicina au Canada. Ce virus à provisoirement été nommé « virus de la gommose et de la fissuration de l'écorce du prunus » (Badnavirus prunumosis).

Cette étude a évalué la dynamique saisonnière des infestations de légionnaire d’automne sur maïs au Bangladesh sur trois années consécutives (six mois de plantation). L’analyse a mis en évidence une réponse non-linéaire en U des infestations selon la période de plantation, avec des pics en octobre et mars (99,3% en février-mars) et un minimum d’infestation en décembre. La gestion intégrée (IPM) a permis de maintenir les infestations en deçà de 4% par rapport au contrôle non traité. Les dommages aux épis et pertes de rendement ont montré des pertes maximales en mars (31,6%). Globalement, un semis précoce (octobre à janvier), surtout combiné à la lutte intégrée, permettrait de limiter l’infestation de Spodoptera frugiperda et d’optimiser la stabilité et le niveau des rendements du maïs au Bangladesh.

Voici une étude montrant que le choix du porte-greffe influence fortement la croissance des agrumes, la présence du psylle asiatique (Diaphorina citri) et la progression du huanglongbing (HLB). Les arbres greffés sur le porte-greffe vigoureux ‘Sunki Tropical’ développaient davantage de pousses et de feuillage, favorisant l’alimentation et la reproduction du psylle. À l’inverse, le porte-greffe nanisant ‘Flying Dragon’ limitait fortement la croissance végétative et réduisait la présence du vecteur. Les résultats suggèrent que les porte-greffes nanisants pourraient constituer un levier intéressant de gestion intégrée du HLB, en réduisant les populations de psylles et le risque de dissémination de la maladie.

Cette étude a réalisé le diagnostic et l'analyse phylogénétique du Huanglongbing causé par Candidatus Liberibacter asiaticus au Népal via PCR et séquençage Sanger sur 1 026 échantillons de feuilles. Parmi les échantillons testés, 255 se sont révélés positifs (24,8 %), confirmant une large diffusion de la maladie. Les séquences népalaises, proches à >99 % des souches mondiales, sont particulièrement apparentées à celles de l’Inde (Pendjab, Meerut), révélant une homogénéité régionale. Ces données soulignent l’urgence de mesures intégrées (matériel végétal sain, lutte contre le psylle) et fournissent une base pour des outils de diagnostiques locaux.