Moteur de recherche VSI

Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).

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Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Réglementation

L’Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) a mis à jour sa base de données sur les plantes hôtes de Xylella fastidiosa (13ème version de la base de données). Le nombre total de plantes hôtes déterminées avec au moins deux méthodes de détection différentes ou positives avec une méthode (entre séquençage et isolement en culture pure) atteint désormais 464 espèces, 210 genres et 71 familles. Ces chiffres s’élèvent, quelles que soient les méthodes de detection utilisées, à 728 espèces végétales, 319 genres et 91 familles.

Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Méthode, outil et mesure de surveillance

Cette étude présente une approche d'IA hybride et itérative qui améliore l'efficacité de calcul, l'interprétabilité et l'évolutivité pour la détection des maladies en temps réel en deux étapes : (a) un classificateur d'apprentissage automatique traditionnel léger qui effectue une classification binaire pour séparer et exclure rapidement les feuilles saines ; (b) un modèle d'apprentissage profond qui identifie la maladie. Lors d'un test à grande échelle portant sur 1 227 images sur un ordinateur portable d'entrée de gamme, le modèle hybride a réduit le temps d'inférence total de 4 548 secondes à seulement 1 010,13 secondes, avec une charge CPU minimale.

Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Estimation du risque épidémiologique

La pyriculariose du riz causée par Magnaporthe oryzae (champignon) touche toutes les parties de la plante et menace la production rizicole, notamment en Corée où sa recrudescence a été observée en 2020 et 2021. Cette étude conduite à l’échelle du paysde 2020 à 2022 a analysé la diversité des races et les caractéristiques pathogènes de 754 isolats de pyriculariose.Vingt-huits isolats représentatifs, particulièrement virulent et diversifiés sont susceptibles d’orienter le développement de cultivars résistants.

L’agrile du frêne, minoritaire en Asie (aire d’origine) mais dévastateur en Amérique du Nord et en Europe, suggère une grande tolérance aux variations climatiques. Cette étude évalue la tolérance au froid des larves selon leur stade de développement et leur phase de diapause. Les larves en stade d’alimentation ou en diapause tardive sont les plus sensibles au gel, tandis que la résistance au froid apparait comme un caractère flexible, qui augmente avec des températures basses et qui varie selon l’origine géographique. Ces résultats améliorent la compréhension des facteurs environnementaux et physiologiques influençant la survie hivernale d’A. planipennis et permettent d’affiner les projections de son potentiel d’expansion.

Dans cette étude, 1 602 métagénomes de sols provenant de 59 pays ont été analysés afin d’identifier 32 agents pathogènes dominants, dont Ralstonia solanacearum, Clavibacter michiganensis et Streptomyces europaeiscabiei. Les concentrations élevées de pathogènes sont surtout observées dans les écosystèmes chauds et les sols agricoles. À l’inverse, une plus grande diversité microbienne, un sol riche en carbone organique et des climats plus froids sont associés à une moindre prévalence de pathogènes. Les résultats de la modélisation prédictive indiquent par ailleurs que plusieurs pathogènes bactériens dominants pourraient voir leur prévalence augmenter dans un contexte de changement climatique, en particulier dans les régions tropicales et subtropicales.

Cette revue analyse comment les événements climatiques extrêmes (vagues de chaleur, sécheresses prolongées, fluctuations rapides de température) influencent les agents pathogènes des plantes, la composition des microbiomes et plus largement, la santé végétale. Les auteurs soulignent que ces épisodes, plus intenses que les tendances climatiques de long terme, peuvent accroître la virulence et l’aire de répartition de nombreux agents pathogènes, affaiblir les défenses des plantes et perturber les fonctions clés des microbiomes.

Organisme nuisible: Popillia japonica | Catégorie : Génétique des populations

Cette étude retrace la propagation et les origines de Popillia japonica en Suisse. L’analyse des données de séquences génomiques d’une quarantaine d’individus provenant de diverses zones infestées suisses associées aux données de séquences d’échantillons provenant du Japon, d’Amérique du Nord, des Açores, d’Italie et du sud de la Suisse a permis de reconstruire l’histoire phylogénétique, la structure des populations, et de révéler des schémas de migration distincts pour P. japonica. Les populations suisses de P. japonica ont deux origines distinctes : celles observées à Bâle, en Valais et en Suisse centrale proviendraient du Tessin et du nord de l’Italie, probablement transportées par la route ou le rail. En revanche, la population proche de l’aéroport de Zurich correspondrait à une introduction séparée, venue d’Amérique du Nord par transport aérien accidentel. Ces résultats montrent l’importance de renforcer la surveillance et d’identifier les voies d’introduction pour mieux limiter sa propagation.

Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Méthode et mesure de lutte

Cette étude analyse l’effet de la gestion du couvert végétal dans les oliveraies méditerranéennes sur les vecteurs de Xylella fastidiosa subsp. pauca ST53, notamment Philaenus spumarius, ainsi que sur les arthropodes auxiliaires. Les résultats montrent que l’élimination obligatoire du couvert végétal dans les oliveraies méditerranéennes, bien qu’efficace pour réduire les populations de vecteurs de X. fastidiosa, crée un compromis avec la conservation des arthropodes bénéfiques comme les pollinisateurs, araignées et carabes. L’effet de cette pratique dépend fortement de la saison : un désherbage au début du printemps peut limiter l’impact sur les organismes bénéfiques si la végétation se régénère rapidement, tandis que les réponses varient pour différents groupes fonctionnels et selon la complexité du paysage. Les auteurs soulignent la nécessité d’études pluriannuelles et d’une meilleure caractérisation des communautés de ces paysages pour affiner la gestion des ravageurs tout en préservant la biodiversité et les services écosystémiques.

Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Risque et impact socio-économique et environnemental

Cette étude analyse l’effet de la gestion du couvert végétal dans les oliveraies méditerranéennes sur les vecteurs de Xylella fastidiosa subsp. pauca ST53, notamment Philaenus spumarius, ainsi que sur les arthropodes auxiliaires. Les résultats montrent que l’élimination obligatoire du couvert végétal dans les oliveraies méditerranéennes, bien qu’efficace pour réduire les populations de vecteurs de X. fastidiosa, crée un compromis avec la conservation des arthropodes bénéfiques comme les pollinisateurs, araignées et carabes. L’effet de cette pratique dépend fortement de la saison : un désherbage au début du printemps peut limiter l’impact sur les organismes bénéfiques si la végétation se régénère rapidement, tandis que les réponses varient pour différents groupes fonctionnels et selon la complexité du paysage. Les auteurs soulignent la nécessité d’études pluriannuelles et d’une meilleure caractérisation des communautés de ces paysages pour affiner la gestion des ravageurs tout en préservant la biodiversité et les services écosystémiques.

Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Méthode et mesure de biocontrôle

Cette revue synthétise les connaissances actuelles sur le rôle du microbiome végétal dans la résistance des plantes aux maladies. Elle résume également les mécanismes sous-jacents à la modulation du microbiome guidée par la plante et la suppression des maladies par les probiotiques.

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