Moteur de recherche VSI
Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).
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Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Méthodes d'analyse et de détection
Résumé de l'article traduit : Esteya vermicola a été utilisé comme agent de lutte biologique efficace pour la gestion du nématode du pin, Bursaphelenchus xylophilus. Des outils pour surveiller les modèles de colonisation et de parasitisme d'E. vermicola sont nécessaires pour l'élaboration de stratégies de lutte biologique hautement efficaces. Parce que la technique PCR TaqMan est efficace pour la quantification des espèces dans les échantillons environnementaux, une méthodologie basée sur la PCR en temps réel a été développée pour la quantification absolue d'E. vermicola via l'ajout d'étalons internes et l'extrapolation de la quantité d'ADN à la longueur des hyphes. Des amorces et une sonde pour le gène d'ARN ribosomal 28S d'E. vermicola ont été conçues et une quantification basée sur PCR TaqMan imbriquée en temps réel a été réalisée. De plus, la mesure du rendement basée sur des normes internes était corrélée à la quantité absolue d'ADN génomique cible. De plus, une courbe d'extrapolation obtenue par microscopie optique et analyse d'image du mycélium a été construite pour la mesure de la longueur des hyphes fongiques. La méthode de quantification absolue développée dans la présente étude fournit une technique sensible et précise pour quantifier la densité fongique dans des échantillons de bois ou d'autres substrats et peut être utilisée comme un outil efficace pour de futures études sur les agents de lutte biologique.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 18
Résumé de l’article traduit : Les «Candidatus Liberibacter spp.» sont associés à la maladie la plus dévastatrice des Huanglongbing agrumes (HLB). Dans des travaux antérieurs, nous avons établi une méthode d’empreinte tissulaire in situ pour la détection de ‘Ca. L. asiaticus’(CLas) dans l’orange douce. Nous avons optimisé le protocole par préincubation de l’anticorps anti-Omp avec 5% (p / v) d’extrait de citron rugueux sain. Ce processus simple a éliminé les réactions croisées entre les agrumes et l’anticorps. Le protocole optimisé a amélioré l’application de l’anticorps polyclonal, et nous démontrons la détection de CLas de toutes les régions du monde, y compris des isolats du Japon, de Thaïlande, du Vietnam, du Pakistan, d’Arabie saoudite, du Brésil, des États-Unis et d’une sélection de souches de Chine représentative de la diversité qui y règne. Le test a également été utilisé pour détecter quatre isolats de ’Ca. L. africanus (CLaf) représentatif de la diversité présente en Afrique du Sud. Les gènes correspondants à la membrane externe correspondants d’isolats représentatifs ont été clones et séquencés. Les séquences codantes étaient hautement conservées et les isolats de CLas et CLaf partageaient une identité de 53,8 à 55,9% entre les espèces au niveau des acides aminés. Le protocole optimisé est efficace pour la reconnaissance des CLas et des CLaf dans les cellules du phloème de différents tissus d’agrumes, quelle que soit l’origine géographique des échantillons HLB. La méthode est simple et évolue bien pour répondre au besoin urgent d’un dépistage précis, sensible et à haut débit des bactéries HLB, et peut jouer un rôle important, en particulier pour les programmes d’inspection et de quarantaine des plantes.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp.Paru dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus | Catégorie : Echelle génétique et moléculaire
Résumé de l'article traduit : Le nématode Bursaphelenchus xylophilus est l'agent causal de la flétrissure du pin, qui cause de graves dommages aux forêts de pins en Chine. L'immunité des plantes joue un rôle important dans la résistance des plantes à de multiples agents pathogènes. L'activation du système immunitaire des plantes est généralement déterminée par les récepteurs immunitaires, y compris les récepteurs de reconnaissance des formes végétales, qui assurent la médiation de la reconnaissance des formes. Cependant, on sait peu de choses sur la reconnaissance des formes moléculaires dans l'interaction entre les pins et B. xylophilus. Sur la base du transcriptome de B. xylophilus aux premiers stades de l'infection et de l'expression transitoire médiée par Agrobacterium tumefaciens et de l'infiltration de protéines recombinantes produites par Pichia pastoris dans de nombreuses espèces végétales, un nouveau modèle moléculaire (BxCDP1) a été caractérisé dans B. xylophilus. Nous avons constaté que BxCDP1 était fortement régulée à la hausse aux premiers stades d'infection de B. xylophilus, et était similaire à une protéine de Pararhizobium haloflavum. Le BxCDP1 a déclenché la mort cellulaire chez Nicotiana benthamiana lorsqu'il était sécrété dans l'apoplaste, et cet effet était dépendant de la kinase 1 associée aux brassinostéroïdes 1, mais indépendant du suppresseur de BIR1-1. BxCDP1 a également présenté une activité induisant la mort cellulaire chez le pin, l'Arabidopsis, la tomate, le poivron et la laitue. BxCDP1 a déclenché la production d'espèces réactives de l'oxygène et l'expression de gènes marqueurs d'immunité déclenchés par PAMP (NbAcre31, NbPTI5 et NbCyp71D20) chez N. benthamiana. Il a également induit l'expression de gènes liés à la pathogenèse (PtPR-3, PtPR-4 et PtPR-5) chez Pinus thunbergii. Ces résultats suggèrent qu'en tant que nouveau modèle moléculaire de B. xylophilus, BxCDP1 peut non seulement être reconnu par de nombreuses espèces végétales, mais déclenche également une immunité innée chez N. benthamiana et des réponses de défense de P. thunbergii.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilusParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 18
Résumé de l'article traduit : La maladie de Pierce (PD) de la vigne (Vitis vinifera) est causée par la bactérie Xylella fastidiosa et est transmise par des insectes suceurs de xylème, tandis que le virus de la vigne rouge (GRBV) provoque la maladie de la tache rouge et est transmis en laboratoire par la cicadelle de la luzerne Spissistilus festinus. L'importance des accumulations d'anthocyanes dans les tissus distincts de la vigne par ces agents pathogènes est inconnue, mais les préférences d'alimentation des vecteurs et les indices olfactifs des anthocyanes hôtes peuvent être importants pour ces étiologies de la maladie. Le phosphate, le sucre et la lumière UV sont connus pour réguler l'accumulation d'anthocyanes via miR828 et le petit locus interférant4 (TAS4), en particulier dans le raisin par la production de petits ARN interférents TAS4a / b / c qui sont différentiellement exprimés et ciblent les transcriptions des facteurs de transcription MYBA5/6/7 pour le découpage post-transcriptionnel et l'anti-sens silencieux. Pour générer des matériaux qui peuvent tester de manière critique les fonctions de ces gènes dans les symptômes des maladies PD et GRBV, nous avons produit des plants de raisin transgéniques ciblant TAS4b et MYBA7 en utilisant la technologie CRISPR / Cas9. Nous avons obtenu cinq lignées MYBA7, toutes avec des événements d'édition bi-alléliques et aucune hors-cible détectée au niveau des loci génomiques avec une homologie de la séquence guide. Nous avons obtenu deux lignes TAS4b éditées indépendantes; l'un bi-allélique, l'autre hétérozygote tandis que les deux présentaient des preuves fortuites d'événements d'édition hors cible bi-alléliques TAS4a au locus paralogue. Aucun phénotype d'accumulation d'anthocyanes visible n'a été observé dans les plantes régénérées, probablement en raison de la présence de loci génétiquement redondants TAS4c et MYBA5 / 6 ou de l'absence de conditions de stress environnemental inductif. Les événements d'édition englobent les insertions à base unique et les délétions di / trinucléotidiques de Vvi-TAS4a / b et Vvi-MYBA7 aux positions attendues à 3 nt en amont de l'ARN guide des motifs adjacents proximaux NGG. Nous avons également identifié des preuves de recombinaisons homologues de TAS4a avec TAS4b sur la cible TAS4a hors cible dans l'une des lignées TAS4b, résultant en un locus chimérique avec un polymorphisme bi-allélique, soutenant des événements de recombinaison indépendants dans des plantes transgéniques associés à des activités apparentes élevées de Cas9. L'absence de phénotypes de pigments visibles évidents dans les plantes éditées a empêché les tests de provocation des agents pathogènes du rôle des anthocyanes dans les mécanismes de résistance / tolérance de l'hôte PD et GRBV. Néanmoins, nous démontrons avec succès la modification du génome d'ARN non codants et de loci de facteurs de transcription MYB qui peuvent servir à de futures caractérisations des fonctions de TAS4a / b / c et MYBA7 dans les voies de réponse au stress biotique / abiotique du développement, physiologiques et environnementales importantes pour la synthèse nutraceutique et les réponses de l'agent pathogène du raisin de cuve.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Dépérissement de la vigneParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 18
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Xylella fastidiosaParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 18
Résumé de l'article traduit : Plusieurs agents pathogènes fongiques provoquent la maladie de la pourriture blanche du raisin et Coniella vitis est un agent pathogène prédominant dans les vignobles chinois. La maladie survient sur les feuilles, les vignes et les baies de fruits, entraînant des pertes de rendement considérables et même la destruction totale des vignobles. Ici, nous présentons le premier projet de génome séquencé par Pacbio et Illumina de C. vitis QNYT13637 et son annotation. Cette séquence du génome fournit une ressource unique qui constituera une base solide pour de futures recherches sur l'exploration des gènes liés à la virulence, l'étude du mécanisme de pathogénicité du pathogène et, enfin, l'amélioration des stratégies de gestion de la pourriture blanche.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Dépérissement de la vigneParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Résumé de l'article traduit : Le nématode du pin (Bursaphelenchus xylophilus, PWN) est une espèce envahissante dévastatrice qui s'étend dans les régions plus froides. Ici, nous avons étudié les mécanismes moléculaires sous-jacents à la résistance à basse température du PWN. Nous avons identifié des gènes exprimés de manière différentielle (DEG) enrichis à basse température dans des données de transcriptome publiées précédemment en utilisant l'Encyclopédie des gènes et génomes de Kyoto (KEGG). La réaction de polymérisation en chaîne quantitative en temps réel (qRT-PCR) a été utilisée pour valider davantage les changements de niveau de transcription de 3 gènes connus du cytochrome P450 à basse température. L'interférence ARN (ARNi) a été utilisée pour valider la fonction de résistance à basse température de 3 gènes du cytochrome P450 de PWN. Nous rapportons que les DEG étaient considérablement enrichis dans deux voies liées au cytochrome P450 sous traitement à basse température. La visualisation par carte thermique des niveaux de transcription des gènes liés au cytochrome P450 a révélé des schémas de transcription très différents entre les PWN traités à basse température et à température régulière. Les niveaux de transcription de 3 gènes du cytochrome P450 de PWN ont été élevés à basse température, et la suppression de ces gènes a diminué les taux de survie de PWN à basse température. En résumé, ces résultats suggèrent que le métabolisme du cytochrome P450 joue un rôle essentiel dans le mécanisme de résistance à basse température du PWN.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilusParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Méthodes pour améliorer la surveillance
Résumé de l'article traduit : Xylella fastidiosa pauca ST53 est la bactérie responsable de millions d'oliviers tués dans le sud de l'Italie. Un travail récent démontre qu'une intégration rationnelle des mesures de contrôle des vecteurs et de la transmission, dans une stratégie basée sur des moyens de contrôle chimiques et physiques, peut gérer l'invasion de Xylella fastidiosa et avoir un impact en dessous d'un seuil économique acceptable. Dans la présente étude, nous proposons une alternative biologique à l'action de lutte chimique, qui implique l'utilisation prédéterminée d'un ennemi naturel disponible de Philaenus spumarius, à savoir Zelus renardii, pour la population de vecteurs adultes et le contrôle biologique des infections. L'article combine deux approches différentes: une expérience de laboratoire pour tester la dynamique de prédation de Zelus renardii sur Philaenus spumarius et son attitude en tant que candidat pour une stratégie d'inondation; une expérience simulée d'inondation, pour tester au préalable l'efficacité d'une telle stratégie, avant de procéder éventuellement à une expérimentation sur le terrain. Avec cette double approche, nous montrons qu'une stratégie d'inondation avec Zelus renardii a le potentiel de fournir une solution efficace et "verte" à l'invasion de Xylella fastidiosa, avec une réduction de l'incidence des agents pathogènes en dessous de 10%. Le modèle de contrôle biologique présenté ici pourrait être prometteur pour contenir l'impact et la propagation de Xylella fastidiosa, après une validation sur le terrain de la technique d'inondation. La sauvegarde du verger, de la production et de l'industrie dans les zones sensibles pourrait ainsi devenir un objectif réalisable, dans des paramètres confortables de durabilité, de sécurité environnementale et de protection phytosanitaire efficace dans la gestion des vergers biologiques.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Xylella fastidiosaParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Notifications de nouveaux cas
Résumé de l'article traduit : Lors de l'indexation biologique des virus dans les agrumes, dans une collection de greffons Symons orange doux (SSO) (Citrus sinensis L. Osbeck) inoculés avec des tissus d'écorce d'agrumes de la province du Pendjab au Pakistan, plusieurs arbres SSO présentaient des symptômes foliaires de jaunissement des veines et marbrure. Le séquençage à haut débit par Illumina d'une préparation d'ARN appauvrie en ARN ribosomiques d'un arbre symptomatique, suivie d'analyses BLAST, a permis d'identifier un nouveau virus, provisoirement appelé virus associé à la marbrure jaune d'agrumes (CiYMaV). Les caractéristiques génomiques de CiYMaV sont typiques des membres du genre Mandarivirus (famille des Alphaflexiviridae). Des particules virales de forme et de taille flexibles allongées ressemblant à celles des mandarivirus ont été observées par microscopie électronique à transmission. Les protéines codées par CiYMaV partagent une identité de séquence élevée, des motifs conservés et des relations phylogénétiques avec les protéines correspondantes codées par le virus indien de la tache annulaire des agrumes (ICRSV) et le virus de la clarification des veines jaunes d'agrumes (CYVCV), les deux membres actuels du genre Mandarivirus. Bien que le CYVCV soit le virus le plus proche de CiYMaV, les deux virus peuvent être différenciés sérologiquement et biologiquement l'un de l'autre. Une méthode de PCR à transcription inverse conçue pour détecter spécifiquement CiYMaV a révélé une prévalence élevée (62%) de ce virus dans 120 agrumes de la province du Punjab, au Pakistan, où le nouveau virus a été trouvé principalement dans une infection mixte par le CYVCV et le virus de la tristeza des agrumes. Cependant, une enquête préliminaire sur des échantillons de 200 agrumes de la province du Yunnan, en Chine, n'a pas détecté CiYMaV dans cette région, suggérant que les données moléculaires, sérologiques et biologiques fournies ici sont opportunes et peuvent aider à prévenir la propagation de ce virus dans pays producteurs d'agrumes.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Mesures de lutte
Résumé de l'article traduit : La brûlure bactérienne du riz (BB), causée par Xanthomonas oryzae pv. oryzae, est l'une des maladies les plus graves du riz. Dans cette étude, nous avons constaté que la mélatonine exogène peut augmenter la résistance du riz au BB. Le traitement des plants de riz avec de la mélatonine exogène (20 µg / ml) a augmenté l'activité de nitrate réductase, d'oxyde nitrique synthase et de peroxydase, permettant des concentrations intracellulaires élevées de mélatonine, d'oxyde nitrique et de H2O2. L'expression de NPR1, un régulateur clé dans la voie de signalisation de l'acide salicylique, a été régulée à la hausse plus de 10 fois lorsque les plantes ont été provoquées par la mélatonine. De même, le niveau d'ARN messager de PDF1.2, un marqueur de défense induit par l'acide jasmonique, était 15 fois plus élevé dans les plantes traitées que dans les plantes témoins. De plus, trois protéines liées à la pathogenèse, PR1b, PR8a et PR9, ont été régulées à la hausse de 20 fois en présence de mélatonine. L'application de mélatonine (100 µg / ml) au riz cultivé dans le sol a réduit l'incidence de BB de 86,21%. Pris ensemble, ces résultats fournissent non seulement une meilleure compréhension de l'immunité innée médiée par la mélatonine contre X. oryzae pv. oryzae dans le riz, mais représentent également une stratégie de culture prometteuse pour protéger le riz contre les infections de X. oryzae pv. oryzae.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Nos piliers
Environnement
Protéger la santé des végétaux pour préserver les ressources économiques, sociales et environnementales qui en dépendent.
Collaboration
Ce sont 7 structures partenaires reconnues en leur expertise dans le secteur de la santé des végétaux qui s’associent pour améliorer la surveillance sanitaire de l’ensemble des végétaux sur le territoire.
Opérationnelle
Développer des expertises permettant une application directe et un usage concret.