Épidémiosurveillance en Santé Végétale

Moteur de recherche VSI


Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).

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Sources
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Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Méthodes d'analyse et de détection

Une étude de modélisation (disponible ici : https://bsppjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/ppa.13238) a permis de mettre en évidence des paramètres importants dans l'épidémiologie de la maladie, tels que le pouvoir infectieux des arbres symptomatiques et asymptomatiques.

  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Xylella fastidiosa
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 28

Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus | Catégorie : Echelle génétique et moléculaire

Résumé de l'article traduit : Le nématode du pin (Bursaphelenchus xylophilus, PWN) est une espèce envahissante dévastatrice qui s'étend dans les régions plus froides. Ici, nous avons étudié les mécanismes moléculaires sous-jacents à la résistance à basse température du PWN. Nous avons identifié des gènes exprimés de manière différentielle (DEG) enrichis à basse température dans des données de transcriptome publiées précédemment en utilisant l'Encyclopédie des gènes et génomes de Kyoto (KEGG). La réaction de polymérisation en chaîne quantitative en temps réel (qRT-PCR) a été utilisée pour valider davantage les changements de niveau de transcription de 3 gènes connus du cytochrome P450 à basse température. L'interférence ARN (ARNi) a été utilisée pour valider la fonction de résistance à basse température de 3 gènes du cytochrome P450 de PWN. Nous rapportons que les DEG étaient considérablement enrichis dans deux voies liées au cytochrome P450 sous traitement à basse température. La visualisation par carte thermique des niveaux de transcription des gènes liés au cytochrome P450 a révélé des schémas de transcription très différents entre les PWN traités à basse température et à température régulière. Les niveaux de transcription de 3 gènes du cytochrome P450 de PWN ont été élevés à basse température, et la suppression de ces gènes a diminué les taux de survie de PWN à basse température. En résumé, ces résultats suggèrent que le métabolisme du cytochrome P450 joue un rôle essentiel dans le mécanisme de résistance à basse température du PWN.

  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 19

Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus | Catégorie : Echelle de la population

Résumé de l'article traduit : CONTEXTE : Monochamus alternatus Hope est l'un des insectes vecteurs du nématode du pin (Bursaphelenchus xylophilus), qui cause la maladie destructrice du flétrissement du pin. Les micro-organismes de l'écosystème, comprenant les plantes, leur environnement et les insectes vecteurs, forment des réseaux complexes. Cette étude présente une analyse systématique du microbiote bactérien dans l'intestin moyen de M. alternatus et sa niche d'habitat. MÉTHODES : L'ADN total a été extrait de 20 types d'échantillons (avec trois répétitions chacun) de M. alternatus et de divers tissus de P. massoniana (pins) sains et infectés. Le séquençage de l'amplicon de l'ADNr 16S a été effectué pour déterminer la composition et la diversité du microbiote bactérien dans chaque échantillon. De plus, les abondances relatives des bactéries dans l'intestin moyen des larves de M. alternatus ont été vérifiées en comptant les UFC (Unité de Formation de Colonies). RÉSULTATS : L'infection par les nématodes du pin a augmenté la diversité microbienne des pins. Bradyrhizobium, Burkholderia, Dyella, Mycobacterium et Mucilaginibacter étaient les genres bactériens dominants dans le sol et les pins infectés. Ces résultats indiquent que la communauté bactérienne des pins infectés peut être associée au microbiote du sol. Fait intéressant, l'abondance du genre Gryllotalpicola était la plus élevée dans l'écorce des pins infectés. Le genre Cellulomonas n'a pas été trouvé dans l'intestin moyen de M. alternatus, mais il a culminé dans le phloème des pins infectés, suivi du phloème des pins sains. De plus, le genre Serratia était non seulement présent dans la niche d'habitat, mais il était également enrichi dans l'intestin moyen de M. alternatus. Les tests unitaires de formation de colonies ont montré que l'abondance relative de Serratia sp. atteint un pic dans l'intestin moyen des larves de stade II (81%). CONCLUSIONS : Dans l'ensemble, les résultats indiquent que le microbiote bactérien dans le sol et dans les pins infectés est corrélé. Le Gryllotalpicola sp. et Cellulomonas sp. sont des marqueurs microbiens potentiels de la maladie du flétrissement du pin. De plus, Serratia sp. pourrait être un agent idéal pour exprimer la protéine insecticide dans l'intestin moyen des insectes par génie génétique, ce qui représente une nouvelle utilisation des microbes pour contrôler M. alternatus.

  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 19

Organisme nuisible: Dépérissement de la vigne | Catégorie : Mesures de lutte

Résumé de l’article traduit : L’anthracnose, causée par Elsinoe ampelina, est une maladie de la vigne économiquement importante dans le sud et le sud-est du Brésil. Le contrôle est obtenu par l’application de soufre de chaux pendant la dormance de la vigne et les pulvérisations fongiques foliaires jusqu’à ce que les baies soient à moitié cultivées. Cette étude a évalué la progression temporelle et spatiale de l’anthracnose de la vigne dans des conditions de terrain afin de décrire la dynamique de la maladie et sa relation avec la survie de l’agent pathogène. L’expérience a été réalisée dans un vignoble de raisin de table Vitis labrusca au Brésil, pendant les saisons de croissance 2014 et 2015. L’incidence de vignes avec des feuilles, des tiges et des baies malades et la gravité de la maladie sur les feuilles ont été enregistrées du débourrement à la véraison. Des modèles monomoléculaires, logistiques et de Gompertz ont été ajustés par régression non linéaire aux données d’incidence et de gravité au fil du temps pour caractériser la progression temporelle. Des analyses ordinaires, un indice de dispersion, une loi de puissance de Taylor modifiée et des analyses de la hiérarchie spatiale ont été utilisés pour caractériser le modèle spatial des plantes malades. Le modèle monomoléculaire a montré le meilleur ajustement pour la progression de l’incidence, avec des taux de progression de la maladie allant de 0,051 à 0,136 par jour. Au cours des deux saisons, l’incidence des plantes malades a atteint 100% un mois après le débourrement. Cependant, l’incidence des feuilles malades par plante était d’environ 60% et la gravité de la maladie foliaire était inférieure à 5% pour les deux années. Les analyses ordinaires et les analyses des indices de dispersion ont révélé que les vignes malades étaient distribuées au hasard sur la majorité des dates d’évaluation. Pendant ce temps, une légère agrégation de vignes malades a été observée dans l’analyse de la loi de puissance de Taylor modifiée. Nos résultats suggèrent que l’évolution de l’incidence et de la sévérité de l’anthracnose au fil du temps est principalement régie par la disponibilité de l’inoculum primaire, qui a survécu dans le vignoble. Par conséquent, les mesures de contrôle de l’anthracnose dans les vignobles brésiliens devraient être axées sur la réduction de l’inoculum dans le vignoble.

  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Dépérissement de la vigne
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 20

Organisme nuisible: Dépérissement de la vigne | Catégorie : Méthodes pour améliorer la surveillance

Résumé de l’article traduit : L’anthracnose, causée par Elsinoe ampelina, est une maladie de la vigne économiquement importante dans le sud et le sud-est du Brésil. Le contrôle est obtenu par l’application de soufre de chaux pendant la dormance de la vigne et les pulvérisations fongiques foliaires jusqu’à ce que les baies soient à moitié cultivées. Cette étude a évalué la progression temporelle et spatiale de l’anthracnose de la vigne dans des conditions de terrain afin de décrire la dynamique de la maladie et sa relation avec la survie de l’agent pathogène. L’expérience a été réalisée dans un vignoble de raisin de table Vitis labrusca au Brésil, pendant les saisons de croissance 2014 et 2015. L’incidence de vignes avec des feuilles, des tiges et des baies malades et la gravité de la maladie sur les feuilles ont été enregistrées du débourrement à la véraison. Des modèles monomoléculaires, logistiques et de Gompertz ont été ajustés par régression non linéaire aux données d’incidence et de gravité au fil du temps pour caractériser la progression temporelle. Des analyses ordinaires, un indice de dispersion, une loi de puissance de Taylor modifiée et des analyses de la hiérarchie spatiale ont été utilisés pour caractériser le modèle spatial des plantes malades. Le modèle monomoléculaire a montré le meilleur ajustement pour la progression de l’incidence, avec des taux de progression de la maladie allant de 0,051 à 0,136 par jour. Au cours des deux saisons, l’incidence des plantes malades a atteint 100% un mois après le débourrement. Cependant, l’incidence des feuilles malades par plante était d’environ 60% et la gravité de la maladie foliaire était inférieure à 5% pour les deux années. Les analyses ordinaires et les analyses des indices de dispersion ont révélé que les vignes malades étaient distribuées au hasard sur la majorité des dates d’évaluation. Pendant ce temps, une légère agrégation de vignes malades a été observée dans l’analyse de la loi de puissance de Taylor modifiée. Nos résultats suggèrent que l’évolution de l’incidence et de la sévérité de l’anthracnose au fil du temps est principalement régie par la disponibilité de l’inoculum primaire, qui a survécu dans le vignoble. Par conséquent, les mesures de contrôle de l’anthracnose dans les vignobles brésiliens devraient être axées sur la réduction de l’inoculum dans le vignoble.

  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Dépérissement de la vigne
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 20

Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Prophylaxie

Selon une étude de l’université de York (disponible ici https://www.nature.com/articles/s41564-020-0719-8), la compétition des bactéries pour le fer pourrait limiter l’incidence des maladies bactériennes.

  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Généralités
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Sanitaire
    Numéro semaine: 21

Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Economie

Une étude publiée dans le journal scientifique PNAS a montré que la maladie causée par Xylella fastidiosa sur les oliviers pourrait coûter des millions d'euros si aucune mesure n'est prise pour limiter la bactérie.

  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Xylella fastidiosa
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Sanitaire
    Année et Pays sujet : 2020, Espagne
    Numéro semaine: 20
  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Xylella fastidiosa
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Sanitaire
    Année et Pays sujet : 2020, Grèce
    Numéro semaine: 20
  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Xylella fastidiosa
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Sanitaire
    Année et Pays sujet : 2020, Italie
    Numéro semaine: 20

Organisme nuisible: Bactrocera dorsalis | Catégorie : Communication / vulgarisation

Le Département de la Réunion lance un appel à projets en vue d’expérimenter toutes les pistes de luttes alternatives, à court, moyen et long terme conduisant à lutter contre les populations de Bactrocera dorsalis. La date limite de soumission des projets est le 31 janvier 2021.

  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Bactrocera dorsalis
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Evènement
    Numéro semaine: 46