Plateforme ESVMoteur de recherche VSI
Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).
Moteur de recherche VSI
Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Echelle génétique et moléculaire
Résumé de l'article traduit : La maladie de Pierce (PD) de la vigne (Vitis vinifera) est causée par la bactérie Xylella fastidiosa et est transmise par des insectes suceurs de xylème, tandis que le virus de la vigne rouge (GRBV) provoque la maladie de la tache rouge et est transmis en laboratoire par la cicadelle de la luzerne Spissistilus festinus. L'importance des accumulations d'anthocyanes dans les tissus distincts de la vigne par ces agents pathogènes est inconnue, mais les préférences d'alimentation des vecteurs et les indices olfactifs des anthocyanes hôtes peuvent être importants pour ces étiologies de la maladie. Le phosphate, le sucre et la lumière UV sont connus pour réguler l'accumulation d'anthocyanes via miR828 et le petit locus interférant4 (TAS4), en particulier dans le raisin par la production de petits ARN interférents TAS4a / b / c qui sont différentiellement exprimés et ciblent les transcriptions des facteurs de transcription MYBA5/6/7 pour le découpage post-transcriptionnel et l'anti-sens silencieux. Pour générer des matériaux qui peuvent tester de manière critique les fonctions de ces gènes dans les symptômes des maladies PD et GRBV, nous avons produit des plants de raisin transgéniques ciblant TAS4b et MYBA7 en utilisant la technologie CRISPR / Cas9. Nous avons obtenu cinq lignées MYBA7, toutes avec des événements d'édition bi-alléliques et aucune hors-cible détectée au niveau des loci génomiques avec une homologie de la séquence guide. Nous avons obtenu deux lignes TAS4b éditées indépendantes; l'un bi-allélique, l'autre hétérozygote tandis que les deux présentaient des preuves fortuites d'événements d'édition hors cible bi-alléliques TAS4a au locus paralogue. Aucun phénotype d'accumulation d'anthocyanes visible n'a été observé dans les plantes régénérées, probablement en raison de la présence de loci génétiquement redondants TAS4c et MYBA5 / 6 ou de l'absence de conditions de stress environnemental inductif. Les événements d'édition englobent les insertions à base unique et les délétions di / trinucléotidiques de Vvi-TAS4a / b et Vvi-MYBA7 aux positions attendues à 3 nt en amont de l'ARN guide des motifs adjacents proximaux NGG. Nous avons également identifié des preuves de recombinaisons homologues de TAS4a avec TAS4b sur la cible TAS4a hors cible dans l'une des lignées TAS4b, résultant en un locus chimérique avec un polymorphisme bi-allélique, soutenant des événements de recombinaison indépendants dans des plantes transgéniques associés à des activités apparentes élevées de Cas9. L'absence de phénotypes de pigments visibles évidents dans les plantes éditées a empêché les tests de provocation des agents pathogènes du rôle des anthocyanes dans les mécanismes de résistance / tolérance de l'hôte PD et GRBV. Néanmoins, nous démontrons avec succès la modification du génome d'ARN non codants et de loci de facteurs de transcription MYB qui peuvent servir à de futures caractérisations des fonctions de TAS4a / b / c et MYBA7 dans les voies de réponse au stress biotique / abiotique du développement, physiologiques et environnementales importantes pour la synthèse nutraceutique et les réponses de l'agent pathogène du raisin de cuve.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Xylella fastidiosaParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 18
Résumé de l'article traduit : Plusieurs agents pathogènes fongiques provoquent la maladie de la pourriture blanche du raisin et Coniella vitis est un agent pathogène prédominant dans les vignobles chinois. La maladie survient sur les feuilles, les vignes et les baies de fruits, entraînant des pertes de rendement considérables et même la destruction totale des vignobles. Ici, nous présentons le premier projet de génome séquencé par Pacbio et Illumina de C. vitis QNYT13637 et son annotation. Cette séquence du génome fournit une ressource unique qui constituera une base solide pour de futures recherches sur l'exploration des gènes liés à la virulence, l'étude du mécanisme de pathogénicité du pathogène et, enfin, l'amélioration des stratégies de gestion de la pourriture blanche.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Dépérissement de la vigneParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Résumé de l'article traduit : Le nématode du pin (Bursaphelenchus xylophilus, PWN) est une espèce envahissante dévastatrice qui s'étend dans les régions plus froides. Ici, nous avons étudié les mécanismes moléculaires sous-jacents à la résistance à basse température du PWN. Nous avons identifié des gènes exprimés de manière différentielle (DEG) enrichis à basse température dans des données de transcriptome publiées précédemment en utilisant l'Encyclopédie des gènes et génomes de Kyoto (KEGG). La réaction de polymérisation en chaîne quantitative en temps réel (qRT-PCR) a été utilisée pour valider davantage les changements de niveau de transcription de 3 gènes connus du cytochrome P450 à basse température. L'interférence ARN (ARNi) a été utilisée pour valider la fonction de résistance à basse température de 3 gènes du cytochrome P450 de PWN. Nous rapportons que les DEG étaient considérablement enrichis dans deux voies liées au cytochrome P450 sous traitement à basse température. La visualisation par carte thermique des niveaux de transcription des gènes liés au cytochrome P450 a révélé des schémas de transcription très différents entre les PWN traités à basse température et à température régulière. Les niveaux de transcription de 3 gènes du cytochrome P450 de PWN ont été élevés à basse température, et la suppression de ces gènes a diminué les taux de survie de PWN à basse température. En résumé, ces résultats suggèrent que le métabolisme du cytochrome P450 joue un rôle essentiel dans le mécanisme de résistance à basse température du PWN.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilusParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Méthodes pour améliorer la surveillance
Résumé de l'article traduit : Xylella fastidiosa pauca ST53 est la bactérie responsable de millions d'oliviers tués dans le sud de l'Italie. Un travail récent démontre qu'une intégration rationnelle des mesures de contrôle des vecteurs et de la transmission, dans une stratégie basée sur des moyens de contrôle chimiques et physiques, peut gérer l'invasion de Xylella fastidiosa et avoir un impact en dessous d'un seuil économique acceptable. Dans la présente étude, nous proposons une alternative biologique à l'action de lutte chimique, qui implique l'utilisation prédéterminée d'un ennemi naturel disponible de Philaenus spumarius, à savoir Zelus renardii, pour la population de vecteurs adultes et le contrôle biologique des infections. L'article combine deux approches différentes: une expérience de laboratoire pour tester la dynamique de prédation de Zelus renardii sur Philaenus spumarius et son attitude en tant que candidat pour une stratégie d'inondation; une expérience simulée d'inondation, pour tester au préalable l'efficacité d'une telle stratégie, avant de procéder éventuellement à une expérimentation sur le terrain. Avec cette double approche, nous montrons qu'une stratégie d'inondation avec Zelus renardii a le potentiel de fournir une solution efficace et "verte" à l'invasion de Xylella fastidiosa, avec une réduction de l'incidence des agents pathogènes en dessous de 10%. Le modèle de contrôle biologique présenté ici pourrait être prometteur pour contenir l'impact et la propagation de Xylella fastidiosa, après une validation sur le terrain de la technique d'inondation. La sauvegarde du verger, de la production et de l'industrie dans les zones sensibles pourrait ainsi devenir un objectif réalisable, dans des paramètres confortables de durabilité, de sécurité environnementale et de protection phytosanitaire efficace dans la gestion des vergers biologiques.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Xylella fastidiosaParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Notifications de nouveaux cas
Résumé de l'article traduit : Lors de l'indexation biologique des virus dans les agrumes, dans une collection de greffons Symons orange doux (SSO) (Citrus sinensis L. Osbeck) inoculés avec des tissus d'écorce d'agrumes de la province du Pendjab au Pakistan, plusieurs arbres SSO présentaient des symptômes foliaires de jaunissement des veines et marbrure. Le séquençage à haut débit par Illumina d'une préparation d'ARN appauvrie en ARN ribosomiques d'un arbre symptomatique, suivie d'analyses BLAST, a permis d'identifier un nouveau virus, provisoirement appelé virus associé à la marbrure jaune d'agrumes (CiYMaV). Les caractéristiques génomiques de CiYMaV sont typiques des membres du genre Mandarivirus (famille des Alphaflexiviridae). Des particules virales de forme et de taille flexibles allongées ressemblant à celles des mandarivirus ont été observées par microscopie électronique à transmission. Les protéines codées par CiYMaV partagent une identité de séquence élevée, des motifs conservés et des relations phylogénétiques avec les protéines correspondantes codées par le virus indien de la tache annulaire des agrumes (ICRSV) et le virus de la clarification des veines jaunes d'agrumes (CYVCV), les deux membres actuels du genre Mandarivirus. Bien que le CYVCV soit le virus le plus proche de CiYMaV, les deux virus peuvent être différenciés sérologiquement et biologiquement l'un de l'autre. Une méthode de PCR à transcription inverse conçue pour détecter spécifiquement CiYMaV a révélé une prévalence élevée (62%) de ce virus dans 120 agrumes de la province du Punjab, au Pakistan, où le nouveau virus a été trouvé principalement dans une infection mixte par le CYVCV et le virus de la tristeza des agrumes. Cependant, une enquête préliminaire sur des échantillons de 200 agrumes de la province du Yunnan, en Chine, n'a pas détecté CiYMaV dans cette région, suggérant que les données moléculaires, sérologiques et biologiques fournies ici sont opportunes et peuvent aider à prévenir la propagation de ce virus dans pays producteurs d'agrumes.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
First Reports.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: SanitaireAnnée et Pays sujet : 2020, ChineNuméro semaine: 21
Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Mesures de lutte
Résumé de l'article traduit : La brûlure bactérienne du riz (BB), causée par Xanthomonas oryzae pv. oryzae, est l'une des maladies les plus graves du riz. Dans cette étude, nous avons constaté que la mélatonine exogène peut augmenter la résistance du riz au BB. Le traitement des plants de riz avec de la mélatonine exogène (20 µg / ml) a augmenté l'activité de nitrate réductase, d'oxyde nitrique synthase et de peroxydase, permettant des concentrations intracellulaires élevées de mélatonine, d'oxyde nitrique et de H2O2. L'expression de NPR1, un régulateur clé dans la voie de signalisation de l'acide salicylique, a été régulée à la hausse plus de 10 fois lorsque les plantes ont été provoquées par la mélatonine. De même, le niveau d'ARN messager de PDF1.2, un marqueur de défense induit par l'acide jasmonique, était 15 fois plus élevé dans les plantes traitées que dans les plantes témoins. De plus, trois protéines liées à la pathogenèse, PR1b, PR8a et PR9, ont été régulées à la hausse de 20 fois en présence de mélatonine. L'application de mélatonine (100 µg / ml) au riz cultivé dans le sol a réduit l'incidence de BB de 86,21%. Pris ensemble, ces résultats fournissent non seulement une meilleure compréhension de l'immunité innée médiée par la mélatonine contre X. oryzae pv. oryzae dans le riz, mais représentent également une stratégie de culture prometteuse pour protéger le riz contre les infections de X. oryzae pv. oryzae.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Résumé de l’article traduit : La tache bactérienne causée par Xanthomonas arboricola pv. pruni a été détectée pour la première fois sur des amandes en Californie en 2013, et elle est signalée ici comme une nouvelle maladie en Californie basée sur le respect des postulats de Koch et l’identification du pathogène à l’aide d’amorces de PCR spécifiques à l’espèce. Les fruits momifiés infectés de la saison de croissance précédente et leurs pédoncules ont été identifiés comme les principaux sites d’hivernage de la bactérie sur l’arbre. Aucun chancre des rameaux n’a été observé et l’agent pathogène n’a pas été récupéré sur des bourgeons dormants. L’isolement des fleurs et des feuilles émergentes n’a réussi que lorsqu’elles ont été collectées à moins de 20 cm d’un fruit infecté et momifié sur l’arbre. L’inoculation de fleurs et de fruits immatures ainsi que de feuilles immatures et matures a entraîné le développement de la maladie, indiquant une longue période de sensibilité de l’hôte au printemps, mais l’incidence de la maladie était la plus élevée dans les inoculations de fruits. Dans les essais sur parcelles fractionnées sur 3 ans, les applications en dormance en décembre ou janvier avec du cuivre ou du cuivre-mancozèbe ont réduit de manière significative la maladie par rapport aux témoins non traités dans les saisons à fortes précipitations, mais elles n’ont eu aucun effet dans les saisons à faibles précipitations. Les applications de cuivre-mancozèbe en cours de saison soit à la chute des pétales ou soit à la pleine floraison et à la chute des pétales ont également permis de réduire la maladie. La phytotoxicité a été observée après des applications répétées de bactéricides de cuivre, en particulier pendant les saisons de faibles précipitations. Les traitements de dormance et en cours de saison des mélanges cuivre-mancozèbe intégrés à l’élimination des fruits momifiés sont actuellement les meilleures stratégies de gestion de la tache bactérienne d’amande en Californie.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Organisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp. | Catégorie : Méthodes d'analyse et de détection
Résumé de l’article traduit : Les «Candidatus Liberibacter spp.» sont associés à la maladie la plus dévastatrice des Huanglongbing agrumes (HLB). Dans des travaux antérieurs, nous avons établi une méthode d’empreinte tissulaire in situ pour la détection de ‘Ca. L. asiaticus’(CLas) dans l’orange douce. Nous avons optimisé le protocole par préincubation de l’anticorps anti-Omp avec 5% (p / v) d’extrait de citron rugueux sain. Ce processus simple a éliminé les réactions croisées entre les agrumes et l’anticorps. Le protocole optimisé a amélioré l’application de l’anticorps polyclonal, et nous démontrons la détection de CLas de toutes les régions du monde, y compris des isolats du Japon, de Thaïlande, du Vietnam, du Pakistan, d’Arabie saoudite, du Brésil, des États-Unis et d’une sélection de souches de Chine représentative de la diversité qui y règne. Le test a également été utilisé pour détecter quatre isolats de ’Ca. L. africanus (CLaf) représentatif de la diversité présente en Afrique du Sud. Les gènes correspondants à la membrane externe correspondants d’isolats représentatifs ont été clones et séquencés. Les séquences codantes étaient hautement conservées et les isolats de CLas et CLaf partageaient une identité de 53,8 à 55,9% entre les espèces au niveau des acides aminés. Le protocole optimisé est efficace pour la reconnaissance des CLas et des CLaf dans les cellules du phloème de différents tissus d’agrumes, quelle que soit l’origine géographique des échantillons HLB. La méthode est simple et évolue bien pour répondre au besoin urgent d’un dépistage précis, sensible et à haut débit des bactéries HLB, et peut jouer un rôle important, en particulier pour les programmes d’inspection et de quarantaine des plantes.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp.Paru dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus | Catégorie : Echelle de la population
Résumé de l'article traduit : CONTEXTE : Monochamus alternatus Hope est l'un des insectes vecteurs du nématode du pin (Bursaphelenchus xylophilus), qui cause la maladie destructrice du flétrissement du pin. Les micro-organismes de l'écosystème, comprenant les plantes, leur environnement et les insectes vecteurs, forment des réseaux complexes. Cette étude présente une analyse systématique du microbiote bactérien dans l'intestin moyen de M. alternatus et sa niche d'habitat. MÉTHODES : L'ADN total a été extrait de 20 types d'échantillons (avec trois répétitions chacun) de M. alternatus et de divers tissus de P. massoniana (pins) sains et infectés. Le séquençage de l'amplicon de l'ADNr 16S a été effectué pour déterminer la composition et la diversité du microbiote bactérien dans chaque échantillon. De plus, les abondances relatives des bactéries dans l'intestin moyen des larves de M. alternatus ont été vérifiées en comptant les UFC (Unité de Formation de Colonies). RÉSULTATS : L'infection par les nématodes du pin a augmenté la diversité microbienne des pins. Bradyrhizobium, Burkholderia, Dyella, Mycobacterium et Mucilaginibacter étaient les genres bactériens dominants dans le sol et les pins infectés. Ces résultats indiquent que la communauté bactérienne des pins infectés peut être associée au microbiote du sol. Fait intéressant, l'abondance du genre Gryllotalpicola était la plus élevée dans l'écorce des pins infectés. Le genre Cellulomonas n'a pas été trouvé dans l'intestin moyen de M. alternatus, mais il a culminé dans le phloème des pins infectés, suivi du phloème des pins sains. De plus, le genre Serratia était non seulement présent dans la niche d'habitat, mais il était également enrichi dans l'intestin moyen de M. alternatus. Les tests unitaires de formation de colonies ont montré que l'abondance relative de Serratia sp. atteint un pic dans l'intestin moyen des larves de stade II (81%). CONCLUSIONS : Dans l'ensemble, les résultats indiquent que le microbiote bactérien dans le sol et dans les pins infectés est corrélé. Le Gryllotalpicola sp. et Cellulomonas sp. sont des marqueurs microbiens potentiels de la maladie du flétrissement du pin. De plus, Serratia sp. pourrait être un agent idéal pour exprimer la protéine insecticide dans l'intestin moyen des insectes par génie génétique, ce qui représente une nouvelle utilisation des microbes pour contrôler M. alternatus.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilusParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19