Épidémiosurveillance en Santé Végétale

Moteur de recherche VSI


Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).

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Organisme nuisible: Bactrocera dorsalis | Catégorie : Méthodes d'analyse et de détection

Cet article met en évidence le développement d’un outil de séquençage rapide et précis permettant d’obtenir de manière modulaire des informations génétiques à différents niveaux taxonomiques. Il permet de détecter des insectes phytopathogènes nuisibles, des bactéries, des champignons, ou encore des nématodes sans a priori sur l’espèce étudiée et sa classification grâce à l’amplification du génome entier (WGA) suivie du séquençage Oxford nanopore MinION.


Organisme nuisible: Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical race 4 | Catégorie : Economie

Cette petite synthèse donne un aperçu concis, pratique et pédagogique sur la fusariose des bananiers, une menace pour la sécurité alimentaire en Afrique.

Non renseigné

Au cours de la surveillance conduite depuis le début de l’année en Estonie dans 20 entreprises de production (68 échantillons prélevés en tout), le ToBRFV a été détecté dans trois d’entre-elles. Pour les trois, il s’agissait d’une petite quantité de plantes infectées qui ont été immédiatement détruites.


Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Evaluation de l'état sanitaire

Une base de données a été alimentée avec des orthophotographies de 2013, 2016 et 2019 permettant de distinguer l’état de santé de chaque olivier (vivant, mort ou symptomatique) dans la région des Pouilles, en Italie. L’application qui permet de visualiser ces données géoréférencées est en ligne et accessible à tous.

Cette étude fait suite aux détections de X. fastidiosa en France. Il met en évidence deux nouveaux variants de Xylella fastidiosa apparentés à la sous-espèce multiplex. Ces deux variants ont été détectés dans deux zones distinctes de la région PACA : ST88 détecté sur Polygala myrtifolia, Hebe sp., Osteospermum ecklonis, Lavandula x intermedia, Coronilla glauca et Euryops chrysanthemoides ; et ST89 détecté sur Myoporum sp. et Viburnum tinus. De plus, X. fastidiosa subsp. multiplex ST6 a été détectée dans une nouvelle région du Sud de la France, l’Occitanie (Aude), dans des plantes issues de milieux naturels et urbains et d’une pépinière.

  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Xylella fastidiosa
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: BHV-SV 2022/11
    Type de veille: Scientifique
    Année et Pays sujet : 2022, France
    Numéro semaine: 11

Organisme nuisible: Bactrocera dorsalis | Catégorie : Echelle de la population

Cette étude vise à mieux comprendre et à prévoir les risques d’invasions futures des mouches des fruits (Tephritidae) à l’échelle mondiale. L’utilité de variables socioéconomiques, biologiques et environnementales pour prédire l’occurrence au niveau national de chaque espèce en dehors de son aire de répartition naturelle à travers un modèle linéaire généralisé à effets mixtes, a été évaluée. Les résultats montrent qu’à de grandes échelles spatiales, les incursions sont plus probables dans les régions à forte intensité économique (fort PIB) et où la surveillance mériterait donc d’être concentrée. A l’inverse, la distance par rapport à l’aire de répartition indigène a montré un effet négatif sur la probabilité qu’un pays donné soit envahi. La plupart des espèces n’ont probablement pas encore envahi toutes les zones climatiquement adaptées et contenant des hôtes appropriés, sachant qu’à ce jour 13 espèces se sont établies dans cinq pays ou moins, et six autres espèces dans plus de 20 pays, comme c’est le cas pour B. dorsalis.

Les auteurs ont évalué dans cette étude la sensibilité des Salicaceae (Populus tremula, Populus canescens, Salix alba et Salix caprea) à Xylella fastidiosa en conditions contrôlées. Toutes les espèces étudiées se sont révélées infectées après inoculation artificielle. De plus, la transmission par P. spumarius de X. fastidiosa ST1 et ST81 a été prouvée sur S. alba. Cette étude prouve que les Salicacées européennes indigènes telles que S. alba ou P. tremula sont de nouveaux hôtes potentiels pour la bactérie.


Organisme nuisible: Bactrocera dorsalis | Catégorie : Méthodes pour améliorer la surveillance

Présentation d’un piège électronique de type McPhail (e-trap) et de ses performances sur le terrain pour surveiller trois mouches des fruits de la famille des Tephritidae : Ceratitis capitata, Bactrocera dorsalis et B. zonata. Le e-trap capture des images des adultes piégés et les télécharge automatiquement sur le serveur distant pour une identification réalisée via un algorithme de classification des insectes. Le prototype testé sur différents terrains (Grèce, Autriche, Italie, Afrique du Sud et Israël) a montré une bonne efficacité et une precision du classifieur de 93-95% en moyenne. Ce piège pourrait être mis en œuvre pour une surveillance automatique des mouches des fruits.

Grâce à des expériences de marquage-libération-recapture (MRR) et de manège de vol, la capacité de vol de Philaenus spumarius et de Aphrophora salicina (de la famille des Aphrophoridae), deux vecteurs avérés et potentiels respectivement de X. fastidiosa, a été étudiée pour l’Europe tempérée. Les résultats ont montré que A. salicina a des performances de vol significativement meilleures que P. spumarius, et que la dispersion est déterminée par la connectivité et la qualité de la plante hôte. L’association d’Aphrophoridae (vecteurs potentiels) et de Salicaceae (plantes hôtes de X. fastidiosa) dans les zones riveraines pourrait créer des réservoirs de la bactérie dans les corridors de dispersion sur des moyennes ou longues distances.


Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Echelle génétique et moléculaire

Cette étude fait suite aux détections de X. fastidiosa en France. Il met en évidence deux nouveaux variants de Xylella fastidiosa apparentés à la sous-espèce multiplex. Ces deux variants ont été détectés dans deux zones distinctes de la région PACA : ST88 détecté sur Polygala myrtifolia, Hebe sp., Osteospermum ecklonis, Lavandula x intermedia, Coronilla glauca et Euryops chrysanthemoides ; et ST89 détecté sur Myoporum sp. et Viburnum tinus. De plus, X. fastidiosa subsp. multiplex ST6 a été détectée dans une nouvelle région du Sud de la France, l’Occitanie (Aude), dans des plantes issues de milieux naturels et urbains et d’une pépinière.

  • Sources: Sources médiatiques
    Organisme nuisible: Xylella fastidiosa
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: BHV-SV 2022/11
    Type de veille: Scientifique
    Année et Pays sujet : 2022, France
    Numéro semaine: 11