Épidémiosurveillance en Santé Végétale

 

Notre programme de travail est défini par le Comité de Pilotage de la Plateforme. Il est révisé annuellement et est principalement structuré autour de groupes de travail méthodologiques ou spécifiques à des dispositifs de surveillance.

Programme de Travail 2021

 

Groupe de travail « Surveillance officielle des organismes nuisibles réglementés ou émergents »
    

► Année de démarrage : 2019 (sous la dénomination « Structuration des plans de surveillance officielle »)

Le règlement 2016/2031/UE sur la santé des végétaux est entré en vigueur le 14 décembre 2019, la surveillance pour l'année 2020 doit donc être menée conformément à ses exigences, en particulier concernant les « organismes de quarantaine prioritaires » pour lesquels la surveillance doit être annuelle.

Afin d'organiser cette surveillance officielle, la DGAL projette la rédaction d'un ordre de méthode constitué d'un ordre de méthode chapeau et d'instructions-filières. Dans l'état actuel du projet, 7 filières sont utilisées : Arboriculture, cultures légumières, forêt, grandes cultures, JEVI, pomme de terre, vigne.

► Mandat

A l’aide de réunions thématiques (au moins) annuelles par filière :
  • Appuyer le référent-expert national pour mettre à jour les documents techniques de la SORE (instructions-filière et leurs annexes, dont les fiches de reconnaissance) ;
  • Recenser les difficultés et les besoins non pourvus (supports, outils, bases de données, formations, matériel, etc.) vis-à-vis de la surveillance officielle pour cette filière ;
  • Proposer et mettre en œuvre un programme de travail pour résoudre ces difficultés et remplir ces besoins ;
  • Construire et évaluer des indicateurs de fonctionnement du dispositif « SORE » ;
  • Veiller à la bonne synergie entre les différents dispositifs de surveillance, officielle ou non, de la filière ;
  • Formuler toute proposition pertinente vis-à-vis de l’amélioration de la surveillance officielle.

A l’aide d’une réunion générale (au moins) :

  • Construire et évaluer des indicateurs de fonctionnement du dispositif « SORE »;
  • Améliorer et mettre à jour les documents techniques transversaux, l’analyse de risque et la programmation, les supports de formation ;
  • Rechercher des synergies entre dispositifs de surveillance;
  • Proposer des améliorations techniques et/ou stratégiques de la SORE.
Groupe de travail « Comité de rédaction des bilans sanitaires »

► Année de démarrage : 2019

► Mandat

Améliorer et fluidifier la rédaction des bilans sanitaires annuels en vue de les rendre plus pertinents et de diminuer leur délai de disponibilité. A cette fin :
  • Clarifier auprès des parties prenantes les attendus de ces bilans.
  • Identifier les points bloquants et les possibilités d'approfondissement (notamment des analyses).
  • Proposer des pistes d'amélioration, par exemple méthodologiques : mise en place d'une organisation avec comité de rédaction, clarification des contributions (co-autorat et relecture).

Le GT pourra s'appuyer sur des travaux homologues menés dans des pays tiers ou dans d'autres domaines (par exemple : Bulletin Épidémiologique, bilans de santé des forêts, bulletins de l'OMS). Les pistes retenues favoriseront la valorisation de tous les acteurs de la chaîne de fabrication de l'information sanitaire.

Groupe de travail « Surveillance de Xylella fastidiosa »
    

► Année de démarrage : 2019

► Mandat

Faire le point sur l'utilisation des données de surveillance, la pertinence des outils et des fréquences de mises à jour au vu du contexte actuel. Trouver avec l'ensemble des acteurs des solutions aux problèmes persistants de qualité, de disponibilité ou d'accessibilité de certaines données, le cas échéant.

Aujourd'hui en France, l'objectif de la surveillance de Xylella fastidiosa est d'abord la détection précoce d'éventuelles introductions de souches d'autres sous-espèces que X.f. multiplex déjà présente sur le territoire, en particulier de X.f. fastidiosa ou X.f. pauca. Le GT cherchera donc à améliorer la précocité de détection, à travers tout moyen pouvant y concourir et particulièrement :

  • Le renforcement de la surveillance événementielle via des actions de sensibilisation et des formations. L'objectif est de permettre, auprès du public concerné, une descente optimale de l'information technique sur X.f., ses hôtes et leurs symptômes, en vue et d'une remontée plus systématique et plus rapide de toute observation de symptômes douteux ;
  • L'évaluation des possibilités d'amélioration de la surveillance aux points d'entrée communautaires, basée sur l'analyse du risque d'introduction et prenant en compte l'ensemble des méthodes d'analyse disponibles ;
  • L'évaluation de l'emploi de la surveillance vectorielle sur la base des résultats obtenus lors des initiatives régionales menées en Corse et en PACA et des données de recherche (LSV, INRAE) disponibles ;
  • L'évaluation de l'adéquation de la distribution de la pression de surveillance officielle sur le territoire vis-à-vis du risque, eu égard aux connaissances scientifiques disponibles et aux données déjà collectées par les différents dispositifs.

Au sein du GT, une cellule pourra être particulièrement chargée d'effectuer des synthèses bibliographiques afin de transférer l'état de l'art à l'action publique, par exemple en formulant des bonnes pratiques de surveillance.

Le deuxième objectif de la surveillance actuelle est la délimitation des zones tampons autour des foyers, où l'essentiel des nouveaux foyers sont détectés. Le GT pourra développer un outil cartographique de suivi des zones tampon, susceptible d'être utilisé facilement en cas de nouveau foyer découvert dans une zone indemne.

Enfin, sur la base de ses études bibliographiques ce GT pourra contribuer à identifier les besoins de recherche intéressant la surveillance.

Groupe de travail « Surveillance du nématode du pin »
    

► Année de démarrage : 2019

► Mandat

Assurer la remontée continue de l'information et le suivi de la mise en œuvre du plan de surveillance (notamment, mais pas seulement, statut et résultats des échantillons, signalements, données import et flux intra-communautaires) via un système d'informations ad hoc. Rendre accessible cette information aux parties prenantes, de manière adaptée.

A l'aide de cet outil de suivi, analyser la cohérence du plan de surveillance effectif vis-à-vis des connaissances scientifiques disponibles, en particulier la pression de surveillance, l'équilibre entre surveillance vectorielle et surveillance du dépérissement des arbres, l'articulation entre surveillance en et hors forêt, et la prise en compte du risque à travers la définition des « sites sensibles ».

Préparer des outils pour la surveillance post-foyer et son suivi.

Communiquer sur les résultats des travaux, en interne et en externe.

Articulation avec le groupe de travail (hors plateforme) « Révision du plan d'urgence ».

Groupe de travail « Surveillance épidémiologique du dépérissement du vignoble »
    

► Année de démarrage : 2019

Ce GT concerne la surveillance des dépérissements dans le vignoble liés à des facteurs biotiques. Sa vocation est d'améliorer la surveillance en vue d'une meilleure valorisation de la connaissance de l'état du vignoble et d'alimenter la recherche. La construction d'un dispositif de surveillance adéquat devrait permettre par la suite l'évaluation de méthodes de prévention et de lutte. Il doit être cohérent avec l'ambition 3 du plan national dépérissement du vignoble.

► Mandat

Sur la base des travaux du GT préfigurateur (état des lieux de mars 2016, dernière réunion le 7 juin 2016) :

  • dresser un état des lieux des réseaux existants, des modalités de collecte de données d'observation (et/ou de prélèvements et analyses), des objectifs recherchés pour chaque réseau et des liens avec les pathogènes impliqués dans le dépérissement du vignoble. Cet inventaire doit prendre en compte les dis-positifs adossés à des travaux de recherche;
  • Évaluer l’adéquation des dispositifs aux objectifs (de connaissance de l’état du vignoble en particulier). Développer les protocoles d’observation et/ou de prélèvements les mieux adaptés au suivi à long terme des maladies du bois, sur la base des connaissances scientifiques disponibles, en vue d’une utilisation par la recherche. Ces protocoles auraient vocation à être utilisés dans le cadre de la surveillance biologique du territoire, ou de tout autre réseau spécialisé identifié au point;
  • Établir un lien et une cohérence avec l’am-bition 3 du plan national dépérissement du vignoble qui organise la mise en place d’un Observatoire national du vignoble destiné à re-cueillir toutes les données en rapport avec la vigne dans une plateforme «big data». Cette plateforme doit recueillir les données accumu-lées dans les réseaux actuels, suivre l’évolution des dépérissements à l’échelle de la parcelle, de l’exploitation ou d’un vignoble et anticiper les crises.

Développer les protocoles d'observation et/ou de prélèvements les mieux adaptés au suivi à long terme des maladies du bois, sur la base des connaissances scientifiques disponibles, en vue d'une utilisation par la recherche. Ces protocoles auraient vocation à être utilisés dans le cadre de la surveillance biologique du territoire, ou de tout autre réseau spécialisé.

Établir un lien et une cohérence avec l'ambition 3 du plan national dépérissement du vignoble qui organise la mis en place d'un Observatoire national du vignoble destiné à recueillir toutes les données en rapport avec la vigne dans une plateforme "big data". Cette plateforme doit recueillir les données accumulées dans les réseaux actuels, suivre l'évolution des dépérissements à l'échelle de la parcelle, de l'exploitation ou d'un vignoble et anticiper les crises.

Groupe de travail « Surveillance du HuangLongBing »
    

► Année de démarrage : 2020

► Mandat

Organiser les échanges entre DROM, et avec la métropole (en particulier la Corse) au sujet de la surveillance et de la recherche sur le HLB et ses vecteurs.

Contribuer à l’amélioration de la surveillance aux différentes étapes épidémiologiques (gestion et reconstruction de la filière aux Antilles ; plan de sauvegarde du verger à la réunion ; maintien du statut indemne en Corse) en lien avec les acteurs de la recherche, de la surveillance, et les organisations de producteurs.

Groupe de travail « Surveillance de la Fusariose Tropicale race 4 - FOCTR4 »
    

► Année de démarrage : 2021

► Mandat

Les objectifs de ce groupe de travail sont :

  • Organiser la communication entre les partenaires et structures impliquées dans la surveillance, la recherche et la gestion de FOC TR4
  • Mettre à disposition des outils pour améliorer la surveillance
  • Former aux techniques de reconnaissance et de détection de la maladie
Groupe de travail « Veille sanitaire internationale »

► Année de démarrage : 2020

"La plateforme est en charge d’assurer une veille internationale sur les dangers sanitaires susceptibles d’avoir un impact sanitaire et/ou économique" (extrait de la convention cadre).

► Mandat

La veille sanitaire internationale regroupe deux composantes complémentaires :
  • la veille événementielle prioritaire et secondaire
  • la veille scientifique

dans un objectif d’anticipation et de mise à jour des connaissances pour le gestionnaire du risque et les acteurs de la surveillance sur le territoire métropolitain et dans les DROM.

La veille événementielle concernant par exemple les notifications, les signalements, ou encore les modifications des stratégies de surveillance, fera l’objet d’une attention toute particulière. La veille scientifique/bibliographique concernera d’abord des informations proches de l’opérationnel et couvrira des thématiques comme la phylogéographie, les distributions spatiales d’espèces, les enveloppes de favorabilité des habitats, les mesures prophylactiques (innovantes) ou encore les méthodes de lutte.

Groupe de travail « Evaluation des dispositifs de surveillance »

► Année de démarrage : 2021

► Mandat

Disposer d’un groupe pérenne, inter-plateformes, dédié à l’évaluation des dispositifs de surveillance. Les membres de ce groupe constitueront un vivier de ressources pour déployer et faire évoluer les méthodes d’évaluation de dispositifs de surveillance quel que soit le domaine concerné : santé animale, santé végétale et chaîne alimentaire.

  • Action 1: Diffuser la méthode d’évaluation Oasis au-près des membres du groupe (voire autres méthodes qui seront retenues), réaliser concrètement des évaluations de dispositifs de surveillance en associant des personnes expérimentées et des « juniors »;
  • Action 2: Faire évoluer la méthode d’évaluation Oasis, en intégrant si possible ou en complétant avec des outils d’évaluation quantitative, économique, sociologique;
  • Action 3: Dans un second temps, mettre en œuvre et déployer l’outil d’évaluation des collaborations entre dispositifs de surveillance (méthode EcoSUR).

Le groupe de travail sera composé d’un groupe plénier qui assurera la réalisation de l’action 1, et d’un sous-groupe méthodologique qui assurera la réalisation de l’action 2, tandis que l’action 3 sera réalisée conjointement par le groupe plénier (pour la mise en œuvre et le suivi des évaluations) et par le sous-groupe (pour les développements méthodologiques).

Groupe de travail inter-plateformes « Qualité des données »

► Année de démarrage : 2019

Dans une approche concertée, multi-partenariale et pluridisciplinaire, les plateformes d’épidémiosurveillance apportent un appui méthodologique et opérationnel aux responsables de dispositifs de surveillance (Etat, professionnels) pour concevoir, déployer, animer et valoriser les dispositifs de surveillance et contribuer ainsi à atteindre un haut niveau de sécurité sanitaire.

La qualité des données de surveillance collectées est un facteur clef de la performance d’un dispositif de surveillance.

Avec les travaux en cours sur les différentes plateformes (ex: optimisation de la surveillance de Salmonella;dans la filière fromage au lait cru, amélioration de la surveillance du nématode du pin, etc…), le besoin de travailler sur la qualité des données a été largement formulé par l'ensemble des acteurs.

L'expérience acquise dans le cadre du GT Qualiplan (Plateforme SCA, amélioration de la qualité des données dans le cadre des PSPC), mais aussi d'autres expériences menées sur les plateformes (ex:suivi des prélèvements réalisés dans le cadre du plan de surveillance de Xylella fastidiosa, démarche qualité appliquée à certaines thématiques de la Plateforme ESA, guide qualité des données de la Plateforme ESA), permettent de construire une réflexion collective, générique et transversale sur la qualité des données.

Cette démarche méthodologique pourrait être reprise individuellement par les différents acteurs, mais aussi collectivement dans les groupes de travail des trois plateformes.

► Mandat

Aboutir à une méthodologie et un vocabulaire communs sur la qualité des données de surveillance et faire appliquer les principes retenus dans les autres groupes de travail.

ACTION 1. Décrire de manière générique ce qu'est une donnée de qualité

  • Définition d'une donnée de qualité ;
  • Critères importants à suivre, définition des standards et nomenclatures de référence, définition des vocabulaires contrôlés, formats de transmission et de validation des données ;
  • NB : La pertinence de la donnée et de ses métadonnées est fonction des objectifs spécifiques de chaque groupe, ces derniers définissant les données à recueillir

ACTION 2. Suivre par des indicateurs

  • Pouvoir évaluer par des outils appropriés la concordance entre les données saisies et les données attendues ;
  • Mettre en place une vérification automatisée avec suivi des vérifications via un indicateur ;
  • Travailler sur les principaux indicateurs de la qualité des données transmises ou saisies sur une interface informatique.

ACTION 3. Animer et échanger avec les différents acteurs

  • Définir de manière générique comment accompagner l'amélioration et le maintien de la qualité des données.

 

 

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