Épidémiosurveillance en Santé Végétale

Moteur de recherche VSI


Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).

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Sources
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Organisme nuisible: | Catégorie : Prophylaxie

Des scientifiques ont découvert chez le frêne des gènes de résistance candidats contre l’agrile du frêne. Une fois validés, ces gènes de résistance pourraient permettre de limiter les conséquences de la maladie. La publication est disponible ici : www.nature.com/articles/s41559-020-1209-3.

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    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Sanitaire secondaire
    Numéro semaine: 22

Organisme nuisible: | Catégorie : Echelle génétique et moléculaire

L'analyse des séquences mitochondriales complètes de trois spécimens de Trioza erytreae, le vecteur de Candidatus Liberibacter africanus (responsable du HLB), prélevés en Éthiopie, en Ouganda et en Afrique du Sud a montré que toutes les séquences identifiées comme T. erytreae n'appartiennent pas à la même espèce et qu'un certain degré de spécificité avec différents hôtes végétaux est susceptible d'exister.

  • Sources: Sources officielles
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 23

Une étude réalisée dans des peuplements d'ormes en Allemagne montre que des génotypes de Candidatus Phytoplasma ulmi seraient étroitement liés aux souches FD-D, FD-C et FD70 de phytoplasmes de la flavescence dorée.

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    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 51

Cette étude date et retrace l'origine de l’introductions de X. fastidiosa à Majorque (Espagne). Un ancêtre commun Californien associé aux amandiers et à la vigne serait à l'origine des infections. La maladie de la brûlure des feuilles d’amandier qui sévit à Majorque résulterait de l’introduction vers 1993 de X. fastidiosa, avant que la bactérie ne se propage à la vigne.

  • Sources: Sources officielles
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Année et Pays sujet : 2020, Espagne
    Numéro semaine: 41
  • Sources: Sources officielles
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Année et Pays sujet : 2020, États-Unis d'Amérique
    Numéro semaine: 41

Résumé de l’article traduit : L’oïdium (Erysiphaceae) est une maladie des plantes nuisible qui survient sur une variété de cultures économiquement importantes. L’oïdium se compose de plus de 873 espèces d’agents pathogènes fongiques qui affectent plus de 10000 espèces végétales. L’identification génétique de l’oïdium est réalisée à l’aide de l’ITS et des grandes régions de sous-unités (LSU) du cluster de gènes d’ARN ribosomal nucléaire. Les régions ITS et LSU de l’oïdium peuvent être utiles dans les enquêtes écologiques, épidémiologiques, phylogénétiques et taxonomiques. Cependant, le séquençage de ces régions n’est pas sans défis. Par exemple, les séquences d’oïdium sont souvent contaminées par de l’ADN végétal et / ou fongique. De plus, il y a généralement une quantité limitée d’ADN présente dans les échantillons, et les échantillons d’ADN plus anciens peuvent se fragmenter avec le temps. Le succès du séquençage de l’oïdium dépend souvent des amorces utilisées pour exécuter la réaction en chaîne par polymérase (PCR). Les amorces doivent être suffisamment larges pour correspondre à la majorité de l’ADN de l’oïdium, mais suffisamment spécifiques pour ne pas s’aligner avec d’autres organismes. Une revue de la taxonomie et de la phylogénie des oïdiums est présentée en mettant l’accent sur le séquençage des régions génomiques ITS + LSU. De plus, nous introduisons un nouveau protocole d’amorce imbriquée pour le séquençage d’échantillons d’herbier d’oïdium qui comprend six nouvelles amorces spécifiques à l’oïdium. Le nouveau protocole de séquençage présenté permet de séquencer de manière cohérente des spécimens âgés de 130 ans maximum. Le séquençage des spécimens d’herbier peut être extrêmement utile pour résoudre de nombreux problèmes écologiques, épidémiologiques, phylogénétiques et taxonomiques dans plusieurs systèmes phytopathogènes, y compris l’oïdium.

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    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 20

Organisme nuisible: | Catégorie : Méthodes pour améliorer la surveillance

Candidatus Phytoplasma solani est l’agent responsable de la maladie du Bois Noir. L’analyse de données spatialisées de 2011 à 2015 montre une tendance d’agrégation de la maladie dans les vergers à très fine échelle (<10m). Cette étude, via l'apport de connaissances sur la dispersion de la maladie, permettra une meilleure gestion des dispositifs de lutte à mettre en place de manière préventive.

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    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 25

Organisme nuisible: | Catégorie : Mesures de lutte

La maladie causée par le nématode du pin peut être gérée par l'application de mesures de lutte appropriées sur le vecteur ou les arbres hôtes infectés. L'élimination des arbres infectés est cruciale dans la gestion de la maladie. Cependant, l’existence d’arbres asymptomatiques rend l'élimination totale de la maladie improbable et demande une surveillance permanente de l'état sanitaire du pays.

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    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 28

Organisme nuisible: | Catégorie : Méthodes d'analyse et de détection

La spectroscopie Raman est une méthode de détection précoce du HLB directement utilisable sur le terrain. En effet, cette étude montre une meilleure sensibilité de la spectroscopie Raman par rapport à la qPCR.

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    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 26

Organisme nuisible: | Catégorie : Notifications de nouveaux cas

First Reports.

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    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Sanitaire prioritaire
    Année et Pays sujet : 2020, Chine
    Numéro semaine: 20