Plateforme ESVMoteur de recherche VSI
Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).
Moteur de recherche VSI
Organisme nuisible: | Catégorie : Echelle de la population
Résumé de l'article traduit : Des estimations quantitatives des populations de vecteurs et de leur infectiosité dans la nature et dans les compartiments cultivés des agroécosystèmes ont été réalisées pour élucider le rôle du compartiment sauvage dans l'épidémiologie de la Flavescence dorée (FD). Sept sites ont été sélectionnés pour les enquêtes dans la région du Piémont en Italie. Ils étaient caractérisés par une grande variété de caractéristiques du paysage agricole et écologique, et comprenaient un vignoble entouré de végétation sauvage. Afin de décrire l'abondance et la prévalence des vecteurs infectés par FD dans les compartiments cultivés et sauvages de l'agroécosystème viticole, des adultes de Scaphoideus titanus ont été collectés par des pièges collants jaunes à l'intérieur et à l'extérieur du vignoble sur la période du 10 juillet au 9 septembre 2015. Ils ont été comptés et analysés séparément pour la présence de phytoplasmes FD par PCR. Les corrélations multifactorielles entre le niveau de la population de vecteurs, la prévalence des insectes infectés à l'intérieur et à l'extérieur des vignobles, la prévalence de la maladie dans les plantes cultivées et sauvages de Vitis et la localisation des plantes sauvages de Vitis par rapport au vignoble ont été analysées. L'abondance des adultes de S. titanus a considérablement diminué à partir de fin juillet, en particulier à l'intérieur du vignoble (moyenne de 22,7 ± 2,5 insectes / piège). Le pourcentage de S. titanus FD-positif était significativement plus élevé à l'extérieur du vignoble (jusqu'à 48% en moyenne) par rapport à l'intérieur du vignoble (jusqu'à 34% en moyenne), et a augmenté au cours de la saison dans les deux compartiments.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 20
Résumé de l'article traduit : Contexte: Les agents pathogènes de distribution mondiale sont confrontés à diverses conditions biotiques et abiotiques dans les populations. De plus, l'histoire écologique et évolutive de chaque population est unique. Xylella fastidiosa est une bactérie vivant dans le xylème infectant plusieurs hôtes végétaux, souvent avec des effets néfastes. En tant que groupe, X. fastidiosa est divisé en sous-espèces distinctes avec des distributions historiques allopatriques et des modèles d'introductions multiples à partir de nombreuses populations sources. La capacité de X. fastidiosa à coloniser avec succès et à provoquer des maladies chez des plantes hôtes naïves varie selon les sous-espèces, et potentiellement, entre les populations. En Amérique centrale (c'est-à-dire au Costa Rica), deux sous-espèces X. fastidiosa coexistent: la sous-espèce native. fastidiosa et le subsp introduit. pauca. En utilisant des séquences du génome entier, les modèles de gain / perte de gène, d'introgression génomique et de diversité génétique ont été caractérisés au Costa Rica et contrastés avec d'autres populations de X. fastidiosa. Résultats: Au Costa Rica, les analyses des génomes accessoires et principaux ont montré un génome hautement malléable avec de nombreux événements de gain / perte intra et inter-sous-spécifiques. De même, des niveaux variables d'introgression inter-sous-spécifique ont été trouvés dans et entre les deux sous-espèces coexistantes; néanmoins, la direction des sous-espèces donneur / receveur vers les segments recombinants variait. Certaines souches semblent se recombiner plus fréquemment que d'autres; cependant, aucun groupe de gènes ou de fonctions géniques n'était surreprésenté dans les segments recombinants. Enfin, les modèles de diversité génétique de subsp. fastidiosa au Costa Rica correspondaient à celles d'autres populations indigènes (c'est-à-dire subsp. pauca au Brésil). Conclusions: Dans l'ensemble, cette étude montre l'importance de caractériser l'histoire évolutive et écologique locale dans le contexte de la distribution mondiale des agents pathogènes.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 21
Organisme nuisible: | Catégorie : Echelle génétique et moléculaire
Résumé de l'article traduit : Contexte: Les agents pathogènes de distribution mondiale sont confrontés à diverses conditions biotiques et abiotiques dans les populations. De plus, l'histoire écologique et évolutive de chaque population est unique. Xylella fastidiosa est une bactérie vivant dans le xylème infectant plusieurs hôtes végétaux, souvent avec des effets néfastes. En tant que groupe, X. fastidiosa est divisé en sous-espèces distinctes avec des distributions historiques allopatriques et des modèles d'introductions multiples à partir de nombreuses populations sources. La capacité de X. fastidiosa à coloniser avec succès et à provoquer des maladies chez des plantes hôtes naïves varie selon les sous-espèces, et potentiellement, entre les populations. En Amérique centrale (c'est-à-dire au Costa Rica), deux sous-espèces X. fastidiosa coexistent: la sous-espèce native. fastidiosa et le subsp introduit. pauca. En utilisant des séquences du génome entier, les modèles de gain / perte de gène, d'introgression génomique et de diversité génétique ont été caractérisés au Costa Rica et contrastés avec d'autres populations de X. fastidiosa. Résultats: Au Costa Rica, les analyses des génomes accessoires et principaux ont montré un génome hautement malléable avec de nombreux événements de gain / perte intra et inter-sous-spécifiques. De même, des niveaux variables d'introgression inter-sous-spécifique ont été trouvés dans et entre les deux sous-espèces coexistantes; néanmoins, la direction des sous-espèces donneur / receveur vers les segments recombinants variait. Certaines souches semblent se recombiner plus fréquemment que d'autres; cependant, aucun groupe de gènes ou de fonctions géniques n'était surreprésenté dans les segments recombinants. Enfin, les modèles de diversité génétique de subsp. fastidiosa au Costa Rica correspondaient à celles d'autres populations indigènes (c'est-à-dire subsp. pauca au Brésil). Conclusions: Dans l'ensemble, cette étude montre l'importance de caractériser l'histoire évolutive et écologique locale dans le contexte de la distribution mondiale des agents pathogènes.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 21
Des séquences génétiques de Xylella fastidiosa subsp. pauca ont été obtenues sur différents hôtes et mises à dispositions pour d'autres études.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 24
Organisme nuisible: | Catégorie : Méthodes pour améliorer la surveillance
Résumé de l'article traduit : Le but des présentes recherches était de simuler le risque annuel de pourriture des grappes (Botrytis cinerea) sur Vitis vinifera L. cv. Riesling raisins sur la base de trois ensembles de données d'évaluation à long terme (n = 3 × 7 = 21 cas) provenant de trois régions viticoles d'Europe centrale. Les périodes où les paramètres météorologiques étaient significativement (p <0,01) corrélés avec le degré-jour cumulatif (CDD7; 18; 24) atteignant 5% de gravité de la maladie ont été déterminés par l'analyse Window Pane. Les analyses ont révélé cinq constellations météorologiques critiques («événements») influençant les épidémies annuelles: des températures relativement basses après le débourrement, des conditions sèches pendant la floraison, des températures élevées après la floraison et des températures basses et des quantités de précipitations élevées pendant / après la véraison étaient toutes associées thermo-temporellement aux premières épidémies. Les données météorologiques de chacun des cinq événements ont servi d'entrée au modèle de risque de pourriture des grappes «BotRisk». Le modèle de régression linéaire multiple a donné un coefficient de détermination ajusté (R2adj.) de 0,63. BotRisk permet (i) la simulation de la position thermo-temporelle de l'épidémie annuelle et, sur cette base, (ii) la classification du risque de pourriture annuelle des grappes en trois classes: risque faible, moyen ou élevé. Selon la validation croisée avec omission, 11 des 21 études de cas ont été correctement classées. Aucun biais systématique causé par l'emplacement n'a été observé, ce qui indique que le transfert du modèle vers d'autres emplacements aux conditions climatiques comparables pourrait être possible. BotRisk (i) représente un nouvel outil d'aide à la décision viticole pour les mesures culturales et chimiques des cultures contre la pourriture des grappes et (ii) permet une estimation du risque de pourriture des grappes dans des conditions environnementales changeantes.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 21
Organisme nuisible: | Catégorie : Notifications de nouveaux cas
Depuis 2017, des dépérissements dans les productions de fraises sont observés au Mexique. Neopestalotiopsis rosae a été détecté comme l'agent pathogène causant ces symptômes pour la première fois sur les fraises.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: Sanitaire prioritaireAnnée et Pays sujet : 2020, MexiqueNuméro semaine: 24
First reports
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: Sanitaire prioritaireAnnée et Pays sujet : 2020, NigériaNuméro semaine: 24
Un nouvel haplotype de Diaphorina citri Kuwayama, vecteur du HLB a été détecté en Éthiopie.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 24
Organisme nuisible: | Catégorie : Prophylaxie
'Norton', un cépage hybride de Vitis aestivalis d'Amérique du nord serait résistant au grapevine vein clearing virus (GVCV).
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueAnnée et Pays sujet : 2020, États-Unis d'AmériqueNuméro semaine: 24
Organisme nuisible: | Catégorie : Mesures de lutte
Les nanosupports de lignine permettraient d'injecter directement dans les plants de vignes des molécules inhibitrices de la croissance de champignons tels que Phaeomoniella chlamydospora et Phaeoacremonium minimum, deux champignons associés à la maladie du bois Esca. En Allemagne, cette technique a montré son efficacité sur Vitis vinifera pendant 4 ans avec une unique injection.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 25