Plateforme ESVMoteur de recherche VSI
Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).
Moteur de recherche VSI
Organisme nuisible: | Catégorie : Echelle génétique et moléculaire
Cette revue scientifique permet de comparer différentes méthodes d’identification des nématodes et de prendre connaissance des nouvelles avancées scientifiques et technologiques sur le sujet.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 39
Résumé de l'article traduit : En 2019, les tomates présentant des symptômes viraux de taches jaunes marbrées étaient abondantes en Israël. Les nouveaux symptômes étaient distincts de ceux typiques de l'infection par le virus de la tomate brune des fruits rugueux (ToBRFV) mais ressemblaient aux symptômes de l'infection par le virus de la mosaïque du pépino (PepMV). L'analyse RT-PCR et les tests sérologiques (dosage immuno-enzymatique, western blot et immunofluorescence in situ) ont révélé et confirmé la présence du tobamovirus ToBRFV et du potexvirus PepMV dans les fruits symptomatiques. Un mélange de particules filiformes et filiformes, caractéristique des virus appartenant aux genres tobamovirus et potexvirus, a été visualisé par microscopie électronique à transmission de l'extrait viral de fruit de tomate. Le séquençage par Sanger de segments de gène de protéine d'enveloppe PepMV amplifiés a montré une identité de séquence d'environ 98% avec la souche chilienne (CH2). Dans un essai biologique testant la contribution des tomates infectées commercialisées à l'établissement de la maladie des plants de tomates, nous avons appliqué des modes d'inoculation directs et indirects en utilisant des plants de tomates résistants au Tm-22. Les résultats, évalués par le développement des symptômes de la maladie ainsi que des analyses sérologiques et moléculaires, ont montré que les fruits co-infectés par ToBRFV et PepMV étaient une source d'inoculum efficace pour la propagation de la maladie uniquement lorsque les fruits étaient endommagés. Il est important de noter que, les fruits intacts n'ont pas propagé la maladie virale. Ces résultats ont ajouté un nouveau facteur à l'épidémiologie de la maladie de ces virus.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 20
Des scientifiques ont découvert chez le frêne des gènes de résistance candidats contre l’agrile du frêne. Une fois validés, ces gènes de résistance pourraient permettre de limiter les conséquences de la maladie. La publication est disponible ici : www.nature.com/articles/s41559-020-1209-3.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: Sanitaire secondaireNuméro semaine: 22
Organisme nuisible: | Catégorie : Mesures de lutte
Cette étude met en évidence la localisation des particules virales du ToBRFV dans les semences au niveau du tégument externe et dans certains cas dans l’endosperme mais jamais dans l’embryon. La transmission des semences infectées aux plantules semble se faire via des micro-lésions pendant la germination avec un taux de transmission qui varie selon l'organe de la plante. Les traitements de désinfection testés (sept au total) dans cette étude montrent 100% d'inactivation du virus mais six traitements laissent l'ARN du virus détectable en RT-qPCR.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 47
Cinq variétés de vignes résistantes à la maladie de Pierce causée par Xylella fastidiosa ont été créées par l'université de Davis en Californie. Quelques plants sont disponibles cette année en Amérique et plus largement en 2021.
- Sources: Sources agronomiquesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: Sanitaire secondaireAnnée et Pays sujet : 2020, États-Unis d'AmériqueNuméro semaine: 21
Organisme nuisible: | Catégorie : Prophylaxie
Cette étude met en évidence la localisation des particules virales du ToBRFV dans les semences au niveau du tégument externe et dans certains cas dans l’endosperme mais jamais dans l’embryon. La transmission des semences infectées aux plantules semble se faire via des micro-lésions pendant la germination avec un taux de transmission qui varie selon l'organe de la plante. Les traitements de désinfection testés (sept au total) dans cette étude montrent 100% d'inactivation du virus mais six traitements laissent l'ARN du virus détectable en RT-qPCR.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 47
Cinq variétés de vignes résistantes à la maladie de Pierce causée par Xylella fastidiosa ont été créées par l'université de Davis en Californie. Quelques plants sont disponibles cette année en Amérique et plus largement en 2021.
- Sources: Sources agronomiquesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: Sanitaire secondaireAnnée et Pays sujet : 2020, États-Unis d'AmériqueNuméro semaine: 21
Organisme nuisible: | Catégorie : Echelle de la population
L'étude des communautés virales associées aux plants de vigne symptomatiques infectés par l'esca soulève des interrogations sur l'écologie d'un virus de type cogu.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 27
Organisme nuisible: | Catégorie : Méthodes d'analyse et de détection
Résumé de l'article traduit : La maladie du flétrissement du pin cause d'énormes pertes économiques à la foresterie de pin en raison de son caractère destructeur et de sa propagation rapide. Cet article propose une méthode de détection et de localisation de la maladie des nématodes du pin à grande échelle en adoptant la technologie de télédétection et d'intelligence artificielle UAV (Unmanned Aerial Vehicle). Les images de télédétection d'UAV ont été améliorées par des outils de vision par ordinateur. Un cadre d'apprentissage en profondeur Faster-RCNN (Faster Region Convolutional Neural Networks) basé sur un réseau RPN (Region Proposition Network) et le réseau de neurones résiduels ResNet ont été utilisés pour former le modèle de détection des arbres morts par la maladie du pin. La fonction de perte et les ancrages dans le RPN du réseau neuronal convolutionnel ont été optimisés. Enfin, la localisation de l'arbre mort par le nématode du pin a été réalisée, ce qui a généré des informations géographiques avec les résultats de la détection. Les résultats montrent que ResNet101 a donné de meilleurs résultats que le réseau neuronal convolutionnel VGG16 (Visual Geometry Group 16). La précision de détection a été améliorée et a atteint environ 90% après une série d'optimisations du réseau, ce qui signifie que les méthodes d'optimisation proposées dans cet article sont réalisables pour la détection d'arbres morts par le nématode du pin.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 21
Organisme nuisible: | Catégorie : Communication / vulgarisation
Liste des organismes nuisibles et maladies prioritaires par ordre alphabétique.
- Sources: Sources officiellesParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: Sanitaire secondaireAnnée et Pays sujet : 2020, Nouvelle-ZélandeNuméro semaine: 20