Moteur de recherche VSI
Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).
Moteur de recherche VSI
Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Echelle génétique et moléculaire
Cette étude date et retrace l'origine de l’introductions de X. fastidiosa à Majorque (Espagne). Un ancêtre commun Californien associé aux amandiers et à la vigne serait à l'origine des infections. La maladie de la brûlure des feuilles d’amandier qui sévit à Majorque résulterait de l’introduction vers 1993 de X. fastidiosa, avant que la bactérie ne se propage à la vigne.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Xylella fastidiosaParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueAnnée et Pays sujet : 2020, États-Unis d'AmériqueNuméro semaine: 42
Résumé de l'article traduit : Le nématode Bursaphelenchus xylophilus est l'agent causal de la flétrissure du pin, qui cause de graves dommages aux forêts de pins en Chine. L'immunité des plantes joue un rôle important dans la résistance des plantes à de multiples agents pathogènes. L'activation du système immunitaire des plantes est généralement déterminée par les récepteurs immunitaires, y compris les récepteurs de reconnaissance des formes végétales, qui assurent la médiation de la reconnaissance des formes. Cependant, on sait peu de choses sur la reconnaissance des formes moléculaires dans l'interaction entre les pins et B. xylophilus. Sur la base du transcriptome de B. xylophilus aux premiers stades de l'infection et de l'expression transitoire médiée par Agrobacterium tumefaciens et de l'infiltration de protéines recombinantes produites par Pichia pastoris dans de nombreuses espèces végétales, un nouveau modèle moléculaire (BxCDP1) a été caractérisé dans B. xylophilus. Nous avons constaté que BxCDP1 était fortement régulée à la hausse aux premiers stades d'infection de B. xylophilus, et était similaire à une protéine de Pararhizobium haloflavum. Le BxCDP1 a déclenché la mort cellulaire chez Nicotiana benthamiana lorsqu'il était sécrété dans l'apoplaste, et cet effet était dépendant de la kinase 1 associée aux brassinostéroïdes 1, mais indépendant du suppresseur de BIR1-1. BxCDP1 a également présenté une activité induisant la mort cellulaire chez le pin, l'Arabidopsis, la tomate, le poivron et la laitue. BxCDP1 a déclenché la production d'espèces réactives de l'oxygène et l'expression de gènes marqueurs d'immunité déclenchés par PAMP (NbAcre31, NbPTI5 et NbCyp71D20) chez N. benthamiana. Il a également induit l'expression de gènes liés à la pathogenèse (PtPR-3, PtPR-4 et PtPR-5) chez Pinus thunbergii. Ces résultats suggèrent qu'en tant que nouveau modèle moléculaire de B. xylophilus, BxCDP1 peut non seulement être reconnu par de nombreuses espèces végétales, mais déclenche également une immunité innée chez N. benthamiana et des réponses de défense de P. thunbergii.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilusParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 18
Résumé de l'article traduit : La maladie de Pierce (PD) de la vigne (Vitis vinifera) est causée par la bactérie Xylella fastidiosa et est transmise par des insectes suceurs de xylème, tandis que le virus de la vigne rouge (GRBV) provoque la maladie de la tache rouge et est transmis en laboratoire par la cicadelle de la luzerne Spissistilus festinus. L'importance des accumulations d'anthocyanes dans les tissus distincts de la vigne par ces agents pathogènes est inconnue, mais les préférences d'alimentation des vecteurs et les indices olfactifs des anthocyanes hôtes peuvent être importants pour ces étiologies de la maladie. Le phosphate, le sucre et la lumière UV sont connus pour réguler l'accumulation d'anthocyanes via miR828 et le petit locus interférant4 (TAS4), en particulier dans le raisin par la production de petits ARN interférents TAS4a / b / c qui sont différentiellement exprimés et ciblent les transcriptions des facteurs de transcription MYBA5/6/7 pour le découpage post-transcriptionnel et l'anti-sens silencieux. Pour générer des matériaux qui peuvent tester de manière critique les fonctions de ces gènes dans les symptômes des maladies PD et GRBV, nous avons produit des plants de raisin transgéniques ciblant TAS4b et MYBA7 en utilisant la technologie CRISPR / Cas9. Nous avons obtenu cinq lignées MYBA7, toutes avec des événements d'édition bi-alléliques et aucune hors-cible détectée au niveau des loci génomiques avec une homologie de la séquence guide. Nous avons obtenu deux lignes TAS4b éditées indépendantes; l'un bi-allélique, l'autre hétérozygote tandis que les deux présentaient des preuves fortuites d'événements d'édition hors cible bi-alléliques TAS4a au locus paralogue. Aucun phénotype d'accumulation d'anthocyanes visible n'a été observé dans les plantes régénérées, probablement en raison de la présence de loci génétiquement redondants TAS4c et MYBA5 / 6 ou de l'absence de conditions de stress environnemental inductif. Les événements d'édition englobent les insertions à base unique et les délétions di / trinucléotidiques de Vvi-TAS4a / b et Vvi-MYBA7 aux positions attendues à 3 nt en amont de l'ARN guide des motifs adjacents proximaux NGG. Nous avons également identifié des preuves de recombinaisons homologues de TAS4a avec TAS4b sur la cible TAS4a hors cible dans l'une des lignées TAS4b, résultant en un locus chimérique avec un polymorphisme bi-allélique, soutenant des événements de recombinaison indépendants dans des plantes transgéniques associés à des activités apparentes élevées de Cas9. L'absence de phénotypes de pigments visibles évidents dans les plantes éditées a empêché les tests de provocation des agents pathogènes du rôle des anthocyanes dans les mécanismes de résistance / tolérance de l'hôte PD et GRBV. Néanmoins, nous démontrons avec succès la modification du génome d'ARN non codants et de loci de facteurs de transcription MYB qui peuvent servir à de futures caractérisations des fonctions de TAS4a / b / c et MYBA7 dans les voies de réponse au stress biotique / abiotique du développement, physiologiques et environnementales importantes pour la synthèse nutraceutique et les réponses de l'agent pathogène du raisin de cuve.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Dépérissement de la vigneParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 18
Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Economie
Résumé de l'article traduit : Xylella fastidiosa est l'agent causal des maladies des plantes qui provoquent des dommages économiques massifs. En 2013, une souche de la bactérie a été détectée pour la première fois sur le territoire européen (Italie), provoquant le syndrome d'Olive Quick Decline. Nous simulons la propagation future de la maladie sur la base de la modélisation de l'adéquation climatique et de l'expansion radiale du territoire envahi. Un modèle économique est développé pour calculer l'impact basé sur les profits et pertes perdus actualisés. Les modèles ont un impact sur l'Italie, la Grèce et l'Espagne, car ces pays représentent environ 95% de la production européenne d'huile d'olive. La modélisation de l'adéquation climatique indique que, selon le seuil d'adéquation, 95,5 à 98,9%, 99,2 à 99,8% et 84,6 à 99,1% des zones nationales de production se situent respectivement en Italie, en Grèce et en Espagne. Pour l'Italie, suite aux taux d'expansion radiaux envisagés, l'impact économique potentiel sur 50 ans varie de 1,9 milliard à 5,2 milliards d'euros pour le pire scénario économique, dans lequel la production cesse après la disparition des vergers. S'il est possible de replanter avec des variétés résistantes, l'impact varie de 0,6 milliard à 1,6 milliard d'euros. Selon que la replantation est réalisable, entre 0,5 et 1,3 milliard d'euros peuvent être économisés en 50 ans si la propagation de la maladie passe de 5,18 à 1,1 km par an. L'analyse souligne la nécessité de renforcer les recherches en cours sur les caractères de résistance des cultivars et l'application de mesures phytosanitaires, y compris la lutte antivectorielle et la suppression des inoculums, en éliminant les plantes hôtes.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Xylella fastidiosaParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 17
Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Mesures de lutte
Résumé de l'article traduit : Xylella fastidiosa est l'agent causal des maladies des plantes qui provoquent des dommages économiques massifs. En 2013, une souche de la bactérie a été détectée pour la première fois sur le territoire européen (Italie), provoquant le syndrome d'Olive Quick Decline. Nous simulons la propagation future de la maladie sur la base de la modélisation de l'adéquation climatique et de l'expansion radiale du territoire envahi. Un modèle économique est développé pour calculer l'impact basé sur les profits et pertes perdus actualisés. Les modèles ont un impact sur l'Italie, la Grèce et l'Espagne, car ces pays représentent environ 95% de la production européenne d'huile d'olive. La modélisation de l'adéquation climatique indique que, selon le seuil d'adéquation, 95,5 à 98,9%, 99,2 à 99,8% et 84,6 à 99,1% des zones nationales de production se situent respectivement en Italie, en Grèce et en Espagne. Pour l'Italie, suite aux taux d'expansion radiaux envisagés, l'impact économique potentiel sur 50 ans varie de 1,9 milliard à 5,2 milliards d'euros pour le pire scénario économique, dans lequel la production cesse après la disparition des vergers. S'il est possible de replanter avec des variétés résistantes, l'impact varie de 0,6 milliard à 1,6 milliard d'euros. Selon que la replantation est réalisable, entre 0,5 et 1,3 milliard d'euros peuvent être économisés en 50 ans si la propagation de la maladie passe de 5,18 à 1,1 km par an. L'analyse souligne la nécessité de renforcer les recherches en cours sur les caractères de résistance des cultivars et l'application de mesures phytosanitaires, y compris la lutte antivectorielle et la suppression des inoculums, en éliminant les plantes hôtes.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Xylella fastidiosaParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 17
Organisme nuisible: Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical race 4 | Catégorie : Méthodes pour améliorer la surveillance
Résumé de l'article traduit : La flétrissure causée par Fusarium oxysporum f.sp. cubense (Foc) est l'une des maladies les plus destructrices de la banane. Pour leur évaluation des risques et la caractérisation des dangers, il est essentiel de déterminer rapidement la virulence des isolats Foc. Cependant, cela prend généralement des semaines ou des mois à l'aide d'analyses de bananiers, ce qui nécessite une meilleure approche pour accélérer le processus avec des résultats fiables. Foc produit diverses mycotoxines, telles que l'acide fusarique (FSA), la beauvericine (BEA) et les enniatines (EN) pour faciliter leur infection. Dans cette étude, nous avons développé un modèle de régression linéaire pour prédire la virulence Foc en utilisant les niveaux de production des trois mycotoxines. Nous avons collecté des données de 40 isolats Foc de 20 groupes de compatibilité végétative (VCG), y compris leurs profils de mycotoxines (LC-MS) et leurs valeurs d'indice de maladie végétale (PDI) sur des plantules de Pisang Awak en serre. Un modèle de régression linéaire a été formé à partir des données collectées en utilisant FSA, BEA et EN comme variables prédictives et les valeurs PDI comme variable de réponse. Les statistiques des tests de linéarité ont montré que ce modèle répond à toutes les hypothèses de linéarité. Nous avons utilisé toutes les données pour prédire l'IDP avec une grande adéquation du modèle (coefficient de détermination (R2 = 0,906) et ajuster le coefficient (R2adj = 0,898)) indiquant un fort pouvoir prédictif du modèle. En résumé, nous avons développé un modèle de régression linéaire utile pour la prédiction de la virulence Foc sur les bananiers à partir de la quantification des mycotoxines dans les souches Foc, ce qui facilitera la détermination rapide de la virulence dans les Fus émergents Foc émergents récemment isolés d'épidémie de banane menaçant les plantations de bananes dans le monde entier.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical race 4Paru dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 17
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 17
Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Notifications de nouveaux cas
First Reports.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ActualitéNuméro semaine: 18
Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus | Catégorie : Méthodes d'analyse et de détection
Résumé de l'article traduit : Esteya vermicola a été utilisé comme agent de lutte biologique efficace pour la gestion du nématode du pin, Bursaphelenchus xylophilus. Des outils pour surveiller les modèles de colonisation et de parasitisme d'E. vermicola sont nécessaires pour l'élaboration de stratégies de lutte biologique hautement efficaces. Parce que la technique PCR TaqMan est efficace pour la quantification des espèces dans les échantillons environnementaux, une méthodologie basée sur la PCR en temps réel a été développée pour la quantification absolue d'E. vermicola via l'ajout d'étalons internes et l'extrapolation de la quantité d'ADN à la longueur des hyphes. Des amorces et une sonde pour le gène d'ARN ribosomal 28S d'E. vermicola ont été conçues et une quantification basée sur PCR TaqMan imbriquée en temps réel a été réalisée. De plus, la mesure du rendement basée sur des normes internes était corrélée à la quantité absolue d'ADN génomique cible. De plus, une courbe d'extrapolation obtenue par microscopie optique et analyse d'image du mycélium a été construite pour la mesure de la longueur des hyphes fongiques. La méthode de quantification absolue développée dans la présente étude fournit une technique sensible et précise pour quantifier la densité fongique dans des échantillons de bois ou d'autres substrats et peut être utilisée comme un outil efficace pour de futures études sur les agents de lutte biologique.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilusParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 18
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 18