Plateforme ESVMoteur de recherche VSI
Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).
Moteur de recherche VSI
Organisme nuisible: Xylella fastidiosa | Catégorie : Echelle génétique et moléculaire
Résumé de l'article traduit : Contexte: Les agents pathogènes de distribution mondiale sont confrontés à diverses conditions biotiques et abiotiques dans les populations. De plus, l'histoire écologique et évolutive de chaque population est unique. Xylella fastidiosa est une bactérie vivant dans le xylème infectant plusieurs hôtes végétaux, souvent avec des effets néfastes. En tant que groupe, X. fastidiosa est divisé en sous-espèces distinctes avec des distributions historiques allopatriques et des modèles d'introductions multiples à partir de nombreuses populations sources. La capacité de X. fastidiosa à coloniser avec succès et à provoquer des maladies chez des plantes hôtes naïves varie selon les sous-espèces, et potentiellement, entre les populations. En Amérique centrale (c'est-à-dire au Costa Rica), deux sous-espèces X. fastidiosa coexistent: la sous-espèce native. fastidiosa et le subsp introduit. pauca. En utilisant des séquences du génome entier, les modèles de gain / perte de gène, d'introgression génomique et de diversité génétique ont été caractérisés au Costa Rica et contrastés avec d'autres populations de X. fastidiosa. Résultats: Au Costa Rica, les analyses des génomes accessoires et principaux ont montré un génome hautement malléable avec de nombreux événements de gain / perte intra et inter-sous-spécifiques. De même, des niveaux variables d'introgression inter-sous-spécifique ont été trouvés dans et entre les deux sous-espèces coexistantes; néanmoins, la direction des sous-espèces donneur / receveur vers les segments recombinants variait. Certaines souches semblent se recombiner plus fréquemment que d'autres; cependant, aucun groupe de gènes ou de fonctions géniques n'était surreprésenté dans les segments recombinants. Enfin, les modèles de diversité génétique de subsp. fastidiosa au Costa Rica correspondaient à celles d'autres populations indigènes (c'est-à-dire subsp. pauca au Brésil). Conclusions: Dans l'ensemble, cette étude montre l'importance de caractériser l'histoire évolutive et écologique locale dans le contexte de la distribution mondiale des agents pathogènes.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Xylella fastidiosaParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 22
Des séquences génétiques de Xylella fastidiosa subsp. pauca ont été obtenues sur différents hôtes et mises à dispositions pour d'autres études.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Xylella fastidiosaParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 25
Organisme nuisible: Dépérissement de la vigne | Catégorie : Méthodes pour améliorer la surveillance
Résumé de l'article traduit : Le but des présentes recherches était de simuler le risque annuel de pourriture des grappes (Botrytis cinerea) sur Vitis vinifera L. cv. Riesling raisins sur la base de trois ensembles de données d'évaluation à long terme (n = 3 × 7 = 21 cas) provenant de trois régions viticoles d'Europe centrale. Les périodes où les paramètres météorologiques étaient significativement (p <0,01) corrélés avec le degré-jour cumulatif (CDD7; 18; 24) atteignant 5% de gravité de la maladie ont été déterminés par l'analyse Window Pane. Les analyses ont révélé cinq constellations météorologiques critiques («événements») influençant les épidémies annuelles: des températures relativement basses après le débourrement, des conditions sèches pendant la floraison, des températures élevées après la floraison et des températures basses et des quantités de précipitations élevées pendant / après la véraison étaient toutes associées thermo-temporellement aux premières épidémies. Les données météorologiques de chacun des cinq événements ont servi d'entrée au modèle de risque de pourriture des grappes «BotRisk». Le modèle de régression linéaire multiple a donné un coefficient de détermination ajusté (R2adj.) de 0,63. BotRisk permet (i) la simulation de la position thermo-temporelle de l'épidémie annuelle et, sur cette base, (ii) la classification du risque de pourriture annuelle des grappes en trois classes: risque faible, moyen ou élevé. Selon la validation croisée avec omission, 11 des 21 études de cas ont été correctement classées. Aucun biais systématique causé par l'emplacement n'a été observé, ce qui indique que le transfert du modèle vers d'autres emplacements aux conditions climatiques comparables pourrait être possible. BotRisk (i) représente un nouvel outil d'aide à la décision viticole pour les mesures culturales et chimiques des cultures contre la pourriture des grappes et (ii) permet une estimation du risque de pourriture des grappes dans des conditions environnementales changeantes.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Dépérissement de la vigneParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 22
Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Notifications de nouveaux cas
Depuis 2017, des dépérissements dans les productions de fraises sont observés au Mexique. Neopestalotiopsis rosae a été détecté comme l'agent pathogène causant ces symptômes pour la première fois sur les fraises.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: SanitaireAnnée et Pays sujet : 2020, MexiqueNuméro semaine: 25
First reports
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp.Paru dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: SanitaireAnnée et Pays sujet : 2020, NigériaNuméro semaine: 25
Un nouvel haplotype de Diaphorina citri Kuwayama, vecteur du HLB a été détecté en Éthiopie.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp.Paru dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 25
First Reports
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp.Paru dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: SanitaireAnnée et Pays sujet : 2020, BrésilNuméro semaine: 26
Organisme nuisible: Dépérissement de la vigne | Catégorie : Prophylaxie
'Norton', un cépage hybride de Vitis aestivalis d'Amérique du nord serait résistant au grapevine vein clearing virus (GVCV).
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Dépérissement de la vigneParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueAnnée et Pays sujet : 2020, États-Unis d'AmériqueNuméro semaine: 25
Organisme nuisible: Dépérissement de la vigne | Catégorie : Mesures de lutte
Les nanosupports de lignine permettraient d'injecter directement dans les plants de vignes des molécules inhibitrices de la croissance de champignons tels que Phaeomoniella chlamydospora et Phaeoacremonium minimum, deux champignons associés à la maladie du bois Esca. En Allemagne, cette technique a montré son efficacité sur Vitis vinifera pendant 4 ans avec une unique injection.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Dépérissement de la vigneParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 26
Organisme nuisible: ToBRFV | Catégorie : Méthodes d'analyse et de détection
Une méthode de détection basée sur le test LAMP a été développée pour le ToBRFV et semble être plus sensible que la qPCR.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: ToBRFVParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 27