Plateforme ESVMoteur de recherche VSI
Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).
Moteur de recherche VSI
Organisme nuisible: Généralités | Catégorie : Méthodes pour améliorer la surveillance
Cet article fait une synthèse de différents modèles utilisés pour quantifier le risque d'invasion ou d'émergence d'organismes nuisibles forestiers.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 39
Résumé de l'article traduit : Contexte : Les maladies du tronc de la vigne (GTD) telles que l'Esca sont parmi les menaces les plus dévastatrices pour la viticulture. En raison du manque de traitements préventifs et curatifs efficaces, Esca provoque de graves pertes économiques dans le monde entier. Comme les symptômes ne se développent pas consécutivement, la véritable incidence de la maladie dans un vignoble est difficile à évaluer. Par conséquent, un suivi annuel est nécessaire. Dans ce contexte, la détection automatique des symptômes pourrait être un grand soulagement pour les vignerons. Les capteurs spectraux se sont avérés efficaces dans la détection des maladies, permettant une acquisition de données non destructive, objective et rapide. Le but de cette étude est d'évaluer la faisabilité de la détection sur le terrain des symptômes d'Esca foliaire sur trois années consécutives en utilisant une imagerie hyperspectrale au sol et multispectrale aéroportée. Résultats : Des modèles de détection de maladies hyperspectrales ont été développés avec succès à l'aide de données de terrain originales ou de données annotées manuellement. Dans une étape suivante, ces modèles ont été appliqués à l'échelle de l'usine. Alors que le modèle utilisant des données annotées a donné de meilleurs résultats au cours du développement, le modèle utilisant des données originales a montré des précisions de classification plus élevées lorsqu'il est appliqué dans des travaux pratiques. De plus, la transférabilité des modèles de détection des maladies à des données inconnues a été testée. Bien que la gamme visible et proche infrarouge (VNIR) ait montré des résultats prometteurs, le transfert de tels modèles est difficile. Les premiers résultats indiquent que des symptômes externes pourraient être détectés au préalable, mais cela nécessite une évaluation plus approfondie. De plus, une approche multispectrale spécifique à l'application a été simulée en identifiant les longueurs d'onde les plus importantes pour les tâches de différenciation, qui ont ensuite été comparées à des données multispectrales réelles. Même si la détection des maladies multispectrales au sol a réussi, la détection aéroportée reste difficile. Conclusions : Dans cette étude, différentes approches pour la détection des symptômes d'Esca foliaire sont présentées. Les deux systèmes de capteurs semblent convenir à la détection sur le terrain de la maladie, même si l'acquisition de données aéroportées doit encore être optimisée. Nos approches de détection des maladies pourraient faciliter la surveillance des phénotypes végétaux dans un vignoble.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Dépérissement de la vigneParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 19
Organisme nuisible: Dépérissement de la vigne | Catégorie : Méthodes d'analyse et de détection
Développement d'un test RT-PCR point final qui détecte tous les vitivirus de la vigne connus et potentiellement d'autres membres du genre Vitivirus.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Dépérissement de la vigneParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 40
Organisme nuisible: Dépérissement de la vigne | Catégorie : Echelle génétique et moléculaire
Résumé de l'article traduit : Contexte : Les maladies du bois de la vigne (GTD) menacent la production mondiale de vin et de raisins de table, réduisant principalement les rendements des raisins et à des stades avancés provoquant la mort des vignes malades. Un GTD particulièrement préoccupant dans la vitiviniculture argentine est la maladie d'étiologie complexe connue localement sous le nom de "Hoja de malvón" (HDM). Au moins quatre champignons différents sont impliqués dans la maladie, ce qui complique le diagnostic et la conception de stratégies de gestion du vignoble. À l'instar de la maladie du raisin Esca, les facteurs qui rendent cette maladie difficile à contrôler sont la présence d'agents pathogènes qui ne sont pas toujours en corrélation avec les symptômes de la maladie ou les changements physiologiques chez l'hôte. Le stress abiotique sur la vigne semble également favoriser le processus pathologique. Sur cette base, il est essentiel d'avoir des outils moléculaires qui permettent des explorations simultanées du statut d'immunité de l'hôte et de la composition du microbiome. Résultats : Une approche métatranscriptomique a été suivie et différentes stratégies de caractérisation du microbiome, par reconstruction de marqueurs moléculaires ou dénombrements uniques au kmer, ont été évaluées. Le microbiome de Malbec était principalement représenté pour les Dothideomycetes et les Actinobacteria. Un rapport Basidiomycota / Ascomycota plus élevé a été trouvé dans les plantes symptomatiques (SYM) que dans les plantes asymptomatiques (ASYM), avec le Basidiomycota Arrambaria destruens trouvé à des niveaux plus élevés dans les plantes SYM. En outre, à partir de lectures dérivées d'ARNm, l'état fonctionnel de l'hôte et les principales fonctions microbiennes basées sur l'expression des gènes ont été évalués. Les mécanismes de tolérance au stress ont été activés sur les plantes ASYM, la synthèse de la spermidine étant l'une des plus importantes, tandis que du côté du microbiome, les voies procaryotes de l'acide tricarboxylique étaient la principale fonction différentielle des plantes SYM. Conclusions : Il s'agit d'un travail de pionnier pour la caractérisation du microbiome endophytique multi-règne dans les tissus ligneux de la vigne cv. Malbec. Plusieurs micro-organismes ayant une interaction négative avec les agents pathogènes GTD ont été identifiés et peuvent être explorés plus avant en tant qu'agents de lutte biologique pour la maladie HDM. L'analyse intégrale employée suggère que la mesure du rapport Basidiomycota / Ascomycota et l'expression des gènes associés à la spermidine aideraient à surveiller l'état sanitaire de la vigne et la propension à développer une maladie HDM. Cette étude fournit un point de départ pour une meilleure compréhension de la maladie HDM qui peut être utilisée comme feuille de route pour le développement ultérieur des pratiques curatives de la DTG.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Dépérissement de la vigneParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 18
Résumé de l'article traduit : Contexte: La maladie de Panama (maladie de la fusariose) causée par Fusarium oxysporum f. sp. cubense race 4 (FOC) menace gravement la production de bananes (Musa spp.) dans le monde entier. La culture intercalaire de bananiers avec des plantes d'Allium a montré un potentiel de réduction de la maladie de Panama. Dans cette étude, six cultivars de ciboulette chinoise (Allium tuberosum Rottler) ont été sélectionnés pour comparer leurs différences d'activité antifongique et de composés actifs. Trois cultivars Duokang Fujiu 11, Fujiuhuang 2 et Duokang Sijiqing avec des niveaux plus élevés de composés antifongiques ont également été utilisés pour la culture intercalaire avec la banane dans les pots et les champs afin de comparer leurs effets sur la croissance et l'incidence des maladies du bananier. Méthodes et résultats: Les six cultivars ont montré des différences significatives dans l'activité antifongique contre la croissance des mycéliums FOC dans les feuilles volatiles et les lixiviats aqueux. Les lixiviats aqueux ont montré une activité antifongique plus forte que les volatils. Le contenu de trois principaux composés antifongiques, le trisulfure de dipropyle (DPT), le trisulfure de diméthyle (DMT) et le 2-méthyl-2-penténal (MP) dans les lixiviats volatils et aqueux, variait considérablement selon les cultivars. Les expériences en pot et au champ ont montré que la culture intercalaire avec trois cultivars de ciboulette chinois sélectionnés améliorait considérablement la croissance végétative du bananier, augmentait les caractéristiques photosynthétiques et le rendement, mais diminuait l'incidence de la maladie de Panama. Conclusions: Nos résultats indiquent que la culture intercalaire avec la ciboulette chinoise montre un potentiel de réduction de la maladie de Panama au bananier et la sélection de cultivars appropriés est vitale pour un contrôle efficace de la maladie.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical race 4Paru dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 22
Organisme nuisible: Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical race 4 | Catégorie : Mesures de lutte
Résumé de l'article traduit : Contexte : Le flétrissement du Fusarium est une maladie destructrice du bananier causée par le Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), en particulier Tropical Race 4 (TR4), qui est un champignon envahissant le xylème. Il était évident que le xylème contenait des macromolécules, telles que des protéines, impliquées dans les processus de résistance aux maladies. Cependant, aucune étude n'a été menée à ce jour pour analyser les changements dans la réponse des protéines du xylème de bananier à Foc TR4. Méthodes : Pour acquérir une compréhension intégrée de l’expression différentielle des protéines dans le xylème de bananier lors d’une infection par Foc TR4, nous avons effectué une analyse protéomique comparative du xylème dans des bananiers résistants «Pahang» et sensibles «Brésiliennes» inoculés avec Foc TR4. Résultats : Un total de 1036 protéines ont été détectées dans le xylème des deux bananiers, parmi lesquelles certaines protéines sont impliquées dans la «transduction du signal», «l'adaptation environnementale», la «biosynthèse des métabolites secondaires» et le «métabolisme lipidique», indiquant que le xylème contenait des protéines liées au système de défense. 129 protéines d'expression différentielle (DEP) ont été identifiées parmi 4 paires de combinaisons résistantes et sensibles testées. Parmi ces DEP, la protéine de réponse induite par l'hypersensibilité 1 (HIR1), la ligase d'ubiquitine E3 (E3) pourraient jouer un rôle négatif dans la réponse de " Pahang " à l'infection par Foc TR4, tandis que l'isomérase de chalcone (CHI), protéine de liaison à l'ARN riche en glycine (GRP) , la carboxylestérase (CXE) et la lipase GDSL (GLIP) pourraient jouer un rôle positif dans la défense de «Pahang» contre l'infection par Foc TR4. Conclusions : le xylème de bananier contenait des protéines liées au système de défense, parmi lesquelles HIRP1, E3, CHI, GRP, CXE et GLIP impliquées dans la défense des bananiers contre Foc TR4. À notre connaissance, ce rapport est le premier à analyser les changements dans la réponse des protéines de la sève de bananier à Foc TR4, ce qui nous aide à explorer les mécanismes moléculaires du bananier résistant au flétrissement du Fusarium.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical race 4Paru dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ScientifiqueNuméro semaine: 20
Organisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp. | Catégorie : Communication / vulgarisation
Un atelier gratuit est organisé par l'Institut Agricole Colombien, il se déroulera virtuellement sur une période de 4 semaines (10 nov- 8 dec) . Parmi les thèmes abordés, le diagnostic du Huanglongbing (HLB) dans les tissus végétaux et la gestion du HLB au travers le partage d'expériences internationales.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp.Paru dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: EvènementAnnée et Pays sujet : 2020, ColombieNuméro semaine: 46
2020 a été proclamée par la FAO comme l'année internationale de la santé des plantes. En effet, face aux menaces du changement climatique et des activités humaines, les écosystèmes sont de plus en plus en danger avec des conséquences importantes sur notre vie.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: GénéralitésParu dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: ActualitéNuméro semaine: 18
Organisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp. | Catégorie : Evaluation de l'état sanitaire
Les contrôles réalisés dans la province d'Entre Rios ont mis en évidence 171 cas suspects et quatre cas positifs de HLB dans les départements de Concordia et de Federación après avoir contrôlé 1 453 hectares d'agrumes. En outre, 57 insectes ont été capturés au cours de la même campagne pour faire le diagnostic permettant de détecter la présence de Candidatus liberibacter.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp.Paru dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: SanitaireAnnée et Pays sujet : 2020, ArgentineNuméro semaine: 41
Organisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp. | Catégorie : Mesures de surveillance
Les contrôles réalisés dans la province d'Entre Rios ont mis en évidence 171 cas suspects et quatre cas positifs de HLB dans les départements de Concordia et de Federación après avoir contrôlé 1 453 hectares d'agrumes. En outre, 57 insectes ont été capturés au cours de la même campagne pour faire le diagnostic permettant de détecter la présence de Candidatus liberibacter.
- Sources: Sources médiatiquesOrganisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp.Paru dans le bulletin hebdomadaire: NonType de veille: SanitaireAnnée et Pays sujet : 2020, ArgentineNuméro semaine: 41