Épidémiosurveillance en Santé Végétale

Moteur de recherche VSI


Le moteur de recherche de la Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale permet d’accéder aux articles (et aux données associées) sélectionnés par le comité éditorial de la Veille Sanitaire Internationale. Il s'agit des articles publiés dans les bulletins ou sur les pages Agenda et Actualités du site web. Le moteur de recherche ne remplace pas les bulletins de la VSI, il permet : (1) d’accéder à des informations ciblées sur une période temporelle choisie via l'utilisation de filtres ; et (2) de télécharger les informations collectées sous format .csv (bouton orange en bas de page de résultats).

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Résumé de l’article traduit : Le Bursaphelenchus mucronatus, qui était très similaire à Bursaphelenchus xylophilus en termes de caractéristiques morphologiques et de propriétés biologiques - mais avait une pathogénicité plus faible pour les forêts - était une espèce indigène souvent déplacée par B. xylophilus lorsqu’elle occupait la même niche. Depuis que le projet de génome du B. xylophilus invasif a été publié, l’absence d’un génome de référence de B. mucronatus nous empêche toujours de comprendre les preuves moléculaires qui sous-tendent les déplacements. Dans cette étude, nous avons utilisé le séquençage SMRT (Single Molecule, Real-Time) et une approche d’échafaudage Hi-C pour produire un assemblage au niveau chromosomique proche de B. mucronatus comprenant six pseudo-chromosomes. La taille de l’ensemble est de 73 Mo, avec un échafaudage N50 de 11,50 Mo et un contig N50 de 1,48 Mo. Les résultats de la génomique comparative ont montré une grande similitude entre B. xylophilus et B. mucronatus. Cependant, la perte de gènes orphelins et de gènes orthologues spécifiques à l’espèce chez B. mucronatus peut indiquer une adaptabilité plus faible à l’environnement. Les contractions de la famille de gènes des GPCR (récepteurs couplés aux protéines G) et des cellulases chez B. mucronatus peuvent conjointement contribuer à son déplacement par B. xylophilus. Dans l’ensemble, nous avons introduit une ressource génomique précieuse pour les études moléculaires et évolutives de B. mucronatus, en particulier pour étudier le déplacement compétitif par le nématode du pin, qui pourrait nous aider à contrôler la pathogénicité des maladies du flétrissement du pin.

  • Sources: Sources officielles
    Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 21

Organisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp. | Catégorie : Mesures de surveillance

Estimation de l'incidence de D. citri dans la région des agrumes du Brésil. L'analyse de la densité spectrale indique que l'on retrouve moitié moins de psylles dans les zones bien gérées par rapport aux zones où les pratiques de gestion du HLB sont médiocres.

  • Sources: Sources officielles
    Organisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp.
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 40

Organisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp. | Catégorie : Prophylaxie

Estimation de l'incidence de D. citri dans la région des agrumes du Brésil. L'analyse de la densité spectrale indique que l'on retrouve moitié moins de psylles dans les zones bien gérées par rapport aux zones où les pratiques de gestion du HLB sont médiocres.

  • Sources: Sources officielles
    Organisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp.
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 40

Cette étude met en évidence la localisation des particules virales du ToBRFV dans les semences au niveau du tégument externe et dans certains cas dans l’endosperme mais jamais dans l’embryon. La transmission des semences infectées aux plantules semble se faire via des micro-lésions pendant la germination avec un taux de transmission qui varie selon l'organe de la plante. Les traitements de désinfection testés (sept au total) dans cette étude montrent 100% d'inactivation du virus mais six traitements laissent l'ARN du virus détectable en RT-qPCR.

  • Sources: Sources officielles
    Organisme nuisible: ToBRFV
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 47

Organisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp. | Catégorie : Méthodes pour améliorer la surveillance

Cette étude réalise le paramétrage d’un modèle regroupant trois types d’analyses du risque phytosanitaire, permettant de prédire l'expansion de Trioza erytreae dans toute la péninsule ibérique.

  • Sources: Sources officielles
    Organisme nuisible: Candidatus Liberibacter spp.
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 35

Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus | Catégorie : Notifications de nouveaux cas

Une étude en laboratoire met en évidence que Monochamus saltuarius (indigène en Chine) est capable de transmettre le nématode du pin sur les pins mais également sur Picea pungens, Picea asperata, et Abies fabri. En 2018, l'EFSA signalait la présence de Monochamus saltuarius en Suisse, Ukraine, Autriche, Italie, Lituanie, Pologne et Allemagne (https://efsa.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.2903/j.efsa.2018.5435).

  • Sources: Sources officielles
    Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Année et Pays sujet : 2020, Chine
    Numéro semaine: 38

Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus | Catégorie : Echelle de la population

Cette revue scientifique permet de comparer différentes méthodes d’identification des nématodes et de prendre connaissance des nouvelles avancées scientifiques et technologiques sur le sujet.

  • Sources: Sources officielles
    Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 39

Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus | Catégorie : Echelle génétique et moléculaire

Cette revue scientifique permet de comparer différentes méthodes d’identification des nématodes et de prendre connaissance des nouvelles avancées scientifiques et technologiques sur le sujet.

  • Sources: Sources officielles
    Organisme nuisible: Bursaphelenchus xylophilus
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 39

Résumé de l'article traduit : En 2019, les tomates présentant des symptômes viraux de taches jaunes marbrées étaient abondantes en Israël. Les nouveaux symptômes étaient distincts de ceux typiques de l'infection par le virus de la tomate brune des fruits rugueux (ToBRFV) mais ressemblaient aux symptômes de l'infection par le virus de la mosaïque du pépino (PepMV). L'analyse RT-PCR et les tests sérologiques (dosage immuno-enzymatique, western blot et immunofluorescence in situ) ont révélé et confirmé la présence du tobamovirus ToBRFV et du potexvirus PepMV dans les fruits symptomatiques. Un mélange de particules filiformes et filiformes, caractéristique des virus appartenant aux genres tobamovirus et potexvirus, a été visualisé par microscopie électronique à transmission de l'extrait viral de fruit de tomate. Le séquençage par Sanger de segments de gène de protéine d'enveloppe PepMV amplifiés a montré une identité de séquence d'environ 98% avec la souche chilienne (CH2). Dans un essai biologique testant la contribution des tomates infectées commercialisées à l'établissement de la maladie des plants de tomates, nous avons appliqué des modes d'inoculation directs et indirects en utilisant des plants de tomates résistants au Tm-22. Les résultats, évalués par le développement des symptômes de la maladie ainsi que des analyses sérologiques et moléculaires, ont montré que les fruits co-infectés par ToBRFV et PepMV étaient une source d'inoculum efficace pour la propagation de la maladie uniquement lorsque les fruits étaient endommagés. Il est important de noter que, les fruits intacts n'ont pas propagé la maladie virale. Ces résultats ont ajouté un nouveau facteur à l'épidémiologie de la maladie de ces virus.

  • Sources: Sources officielles
    Organisme nuisible: ToBRFV
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 20

Organisme nuisible: ToBRFV | Catégorie : Mesures de lutte

Cette étude met en évidence la localisation des particules virales du ToBRFV dans les semences au niveau du tégument externe et dans certains cas dans l’endosperme mais jamais dans l’embryon. La transmission des semences infectées aux plantules semble se faire via des micro-lésions pendant la germination avec un taux de transmission qui varie selon l'organe de la plante. Les traitements de désinfection testés (sept au total) dans cette étude montrent 100% d'inactivation du virus mais six traitements laissent l'ARN du virus détectable en RT-qPCR.

  • Sources: Sources officielles
    Organisme nuisible: ToBRFV
    Paru dans le bulletin hebdomadaire: Non
    Type de veille: Scientifique
    Numéro semaine: 47